Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_199293.3

Sequence Length

1908 nt

GC Content

0.6614

AGACGGAGCCCGGACCUCCACACUGAGCCAUGCCCACCCCCGACGCCACCACGCCACAGGCCAAGGGCUUCCGCAGGGCCGUGUCUGAGCUGGACGCCAAGCAGGCAGAGGCCAUCAUGGGCGCCCCGGGGCCCAGCCUCACAGGCUCUCCGUGGCCUGGAACUGCAGCCCCAGCUGCAUCCUACACCCCCACCCCAAGGUCCCCGCGGUUCAUUGGGCGCAGGCAGAGCCUCAUCGAGGACGCCCGCAAGGAGCGGGAGGCGGCGGUGGCAGCAGCGGCCGCUGCAGUCCCCUCGGAGCCCGGGGACCCCCUGGAGGCUGUGGCCUUUGAGGAGAAGGAGGGGAAGGCCGUGCUAAACCUGCUCUUCUCCCCGAGGGCCACCAAGCCCUCGGCGCUGUCCCGAGCUGUGAAGGUGUUUGAGACGUUUGAAGCCAAAAUCCACCAUCUAGAGACCCGGCCCGCCCAGAGGCCGCGAGCUGGGGGCCCCCACCUGGAGUACUUCGUGCGCCUCGAGGUGCGCCGAGGGGACCUGGCCGCCCUGCUCAGUGGUGUGCGCCAGGUGUCAGAGGACGUGCGCAGCCCCGCGGGGCCCAAGGUCCCCUGGUUCCCAAGAAAAGUGUCAGAGCUGGACAAGUGUCAUCACCUGGUCACCAAGUUCGACCCUGACCUGGACUUGGACCACCCGGGCUUCUCGGACCAGGUGUACCGCCAGCGCAGGAAGCUGAUUGCUGAGAUCGCCUUCCAGUACAGGCACGGCGACCCGAUUCCCCGUGUGGAGUACACCGCCGAGGAGAUUGCCACCUGGAAGGAGGUCUACACCACGCUGAAGGGCCUCUACGCCACGCACGCCUGCGGGGAGCACCUGGAGGCCUUUGCUUUGCUGGAGCGCUUCAGCGGCUACCGGGAAGACAAUAUCCCCCAGCUGGAGGACGUCUCCCGCUUCCUGAAGGAGCGCACGGGCUUCCAGCUGCGGCCUGUGGCCGGCCUGCUGUCCGCCCGGGACUUCCUGGCCAGCCUGGCCUUCCGCGUGUUCCAGUGCACCCAGUAUAUCCGCCACGCGUCCUCGCCCAUGCACUCCCCUGAGCCGGACUGCUGCCACGAGCUGCUGGGGCACGUGCCCAUGCUGGCCGACCGCACCUUCGCGCAGUUCUCGCAGGACAUUGGCCUGGCGUCCCUGGGGGCCUCGGAUGAGGAAAUUGAGAAGCUGUCCACGCUGUACUGGUUCACGGUGGAGUUCGGGCUGUGUAAGCAGAACGGGGAGGUGAAGGCCUAUGGUGCCGGGCUGCUGUCCUCCUACGGGGAGCUCCUGCACUGCCUGUCUGAGGAGCCUGAGAUUCGGGCCUUCGACCCUGAGGCUGCGGCCGUGCAGCCCUACCAAGACCAGACGUACCAGUCAGUCUACUUCGUGUCUGAGAGCUUCAGUGACGCCAAGGACAAGCUCAGGAGCUAUGCCUCACGCAUCCAGCGCCCCUUCUCCGUGAAGUUCGACCCGUACACGCUGGCCAUCGACGUGCUGGACAGCCCCCAGGCCGUGCGGCGCUCCCUGGAGGGUGUCCAGGAUGAGCUGGACACCCUUGCCCAUGCGCUGAGUGCCAUUGGCUAGGUGCACGGCGUCCCUGAGGGCCCUUCCCAACCUCCCCUGGUCCUGCACUGUCCCGGAGCUCAGGCCCUGGUGAGGGGCUGGGUCCCGGGUGCCCCCCAUGCCCUCCCUGCUGCCAGGCUCCCACUGCCCCUGCACCUGCUUCUCAGCGCAACAGCUGUGUGUGCCCGUGGUGAGGUUGUGCUGCCUGUGGUGAGGUCCUGUCCUGGCUCCCAGGGUCCUGGGGGCUGCUGCACUGCCCUCCGCCCUUCCCUGACACUGUCUGCUGCCCCAAUCACCGUCACAAUAAAAGAAACUGUGGUCUCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-886.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -919.76

Frequency: 0.0000

Diversity: 463.85

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((.(((((((((.(((((..((((((((((...((((((((((((....((((((((((...((((((.((.((((((.((((.((.(((..(((.....))).(((((.....(((((.(....).)))))))))).((((((......))))))....((((((....))))))((..(((((..(((.(((.((((((((.(((((..(((((((((((...)))).......).))))))....(((.((((.((((((((.((....)).))))))))..))))))).)))))))))))))...))).((((((((((((((.((((((((.(((...(((...)))...)))..)))))))).))))))))))..))))(((((.......)))))..)))..)))))..))....((((....)))).....))).))..)))).))))))))...))))))((.((((((((((((.(((((((.((((((((.......))))))))(((.(((((((((((..(((((((...(.(((.(((((.(.((........)).)))))))))).))))))))).))))))))))))..(((((...((.(((((.(.(((((..((((((.....))).)))...))))).).)))))))...))))).....(((((...))))).)))))))...((((....((((((((....((.(((((((.((((((((....(((((((((.....(((((......)))))....))))).......))))..)))))))).))))).)).))((((((((.((.((((.((...(((.((((.((((.....)))).))))...)))...)))))))).))))))))......((((.(((....(((.((....)).))).)))))))))))))))...).)))...)))))))))))))))))))))))).((((...(((((((..((((((...((((((((.(((.....(((((((((((((((...(((((..((((....(((....))).......(((....))).)))).)))))......)).))))))))))))).))).))))))))..(((......))).)))))).)).)))))..)))))))))))...)))))((((....)))).........(((.......)))))).)))))))..)))))))))))))).))).((((((.((((((((.((((((((..(((..(((((.....(((((..(((((.((........)).)))))..))))))))))..))).))))))))(((((((.(((((((....)))))))......((((..(((......))).)))).(((.((((((((.....)))..))))).)))....(((.(((((.....((((((((((..((((((..((((.(((((...........((((((((...(((..((.((((((.((.(((....))).)).))))))))..)))(((((((((((......))))))))))).((...(((((((((.......(((.(((((((.((((.(...((((((........(((......)))...(((....(((((.((((((.((((....)))).)))))).)))))))).......))))))...).)))).(((.......)))..)))))))))).)))))))))...)).)))))))).))))).))))..))))))..))).)))))))....))))))))..)))))))..((((((.........))))))....))))))))......))))))......(((((.((..(.......)..)).))))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((((,(((((((..(((.{{((,,.((,(({,..,{,{({(((({(((({{,{(({..,|||....(((((((.(((...(((((((.,,...((((((..((((.(((...(((((((((((((((((((((,.....(((.(((.(((((({...((((((....)))))){{..(((((..(((.(((.((((((((.(((((..,((((({{(((...}}||,...,,,}.})))}|,...(((.((((.((((((((.((....)).))))))))..))))))).)))))))))))))...))).((((((((((((((.((((((((.(((...(((...)))...))).,}))))))).))))))))))..))))(((((.,....,)))))..)))..)))))..}},...{(((....)))}...,........{.{({,.((((.({(((.(((((((.((((((((((((.(((((((.{{,{{((({{{{{,.,},)))))||{.(((((((((((..(((((((...(.(({.(((({,{.{(,{,....,)),))))))}))).))))))))),}))))))))|||..(((((...((.(((((.(.(((((..((({{{.....}}).)))...))))).).)))))))...))))),}}..(((((...))))).)))))))...|{{{,,|.((({{(((....{{.{((((((.((((((((....(((((((,,..}}},{(((.{{.{{||,,,...}))))).}},...))))..)))))))).))))).)}.},((((((((.({{((((.((.,.(((.((((.((((.....)))).))))...)))...)))))))).))))))))......((({,(((....(((,({....)).))}.))))))))}}}}}}}..,),)))...))))))))))))))))))).)))).)))).}..})).(((((((((......((((((((((.({((({((((..(((((((,{((((,....,((({{.(((((((,({,...{{.{{(,...|||,.{{|{{||{{{..,(,(((((.,((((..,.)}))..}}.))))}...}},.....},)))))))..)})))))...,)).))))),..})))),,{{{{,,.,)))).........,||,,.....)}))))))))..)))),})))).)))))))).))..((((.((((((((((((((((((.,((....((((.(((((.(.((({((((((((.{(,((((.(((((,,,((((.((((((...)))))))))))..,,,{,(((((((....)))))))......((((..(((......))).)))).,,,.((((((({{...|))},.})))}.}|||.,,,|||},}}}}}}.{{{.....}}}|(((((((..((((.....)))).{((({({({....}},))...)))).)))))))}..}}...))))).)))))).))))))))((((((((((((......))))))))))))(((.(((,((.....))))).))))))).).))))))))))},.)))})})))...))))))))..)).))))...))))))).))})))))).))).)))))))))))))))))))))))...))).)))))))))))))}))))).))).))))))))....||,.,.{{((......)))),)})})}.,)))))).)))}).))}},,.))),.))))))).}....)))))){((((,..,((((((.,.......))))}),),,,..}}}}}.,...}}}|...........||,.|{{,{,......,..,,,)))))}}...