Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_199443.3
Sequence Length
3929 nt
GC Content
0.4989
GGGCCGGCUGGGCCGGGGCCGCGGAGGAGAUGGCGGAAGGUGGAGGCUGCCGUGAGCGACCGGAUGCGGAGACUCAGAAGUCCGAGCUUGGACCCUUAAUGAGGACCACACUCCAACGCGGGGCGCAGUGGUAUCUUAUUGACAGCCGGUGGUUCAAGCAGUGGAAGAAGUAUGUGGGCUUUGACAGCUGGGACAUGUACAAUGUGGGUGAACAUAACCUAUUUCCUGGCCCAAUAGACAACUCUGGGCUAUUUUCAGAUCCUGAGAGUCAGACCUUGAAAGAACACUUAAUUGAUGAAUUGGACUAUGUAUUGGUCCCUACCGAGGCGUGGAAUAAACUACUAAACUGGUACGGCUGUGUAGAAGGCCAGCAACCCAUCGUCAGAAAAGUUGUGGAGCAUGGCCUGUUUGUCAAGCACUGCAAAGUCGAGGUGUAUUUGCUGGAACUGAAGCUCUGUGAGAACAGUGACCCCACCAAUGUGCUGAGUUGCCAUUUCAGCAAGGCAGACACCAUUGCAACCAUCGAGAAAGAGAUGCGGAAGCUAUUCAACAUCCCUGCGGAGCGUGAAACACGGCUCUGGAACAAAUACAUGAGCAACACCUACGAGCAGUUGAGCAAGCUAGACAACACUGUCCAGGAUGCUGGGCUAUACCAGGGUCAGGUGCUAGUAAUUGAGCCUCAAAAUGAAGAUGGCACAUGGCCCAGGCAGACCUUGCAGUCAAAUGGAUCUGGCUUUUCUGCUUCGUAUAAUUGUCAGGAGCCACCAUCCUCUCAUAUACAACCUGGGCUCUGUGGACUUGGAAACCUGGGAAACACCUGCUUCAUGAACUCCGCUUUGCAGUGUUUGAGCAACACUGCACCACUGACUGACUACUUUCUCAAAGAUGAGUAUGAAGCCGAAAUCAACAGAGACAACCCUCUGGGGAUGAAAGGGGAAAUUGCAGAAGCCUAUGCUGAACUCAUUAAGCAGAUGUGGUCUGGAAGGGACGCCCAUGUGGCACCUCGCAUGUUCAAAACUCAAGUAGGACGUUUUGCUCCUCAAUUUUCUGGCUACCAGCAACAAGAUUCUCAGGAGCUGCUGGCCUUUCUUCUAGAUGGAUUGCAUGAAGAUCUGAACCGGGUAAAGAAAAAGCCCUACUUGGAGCUGAAGGAUGCCAAUGGGCGGCCAGAUGCGGUGGUGGCAAAGGAAGCCUGGGAGAAUCACAGGUUGAGGAAUGAUUCUGUGAUUGUGGAUACUUUCCAUGGCCUCUUCAAAUCUACUUUGGUUUGCCCAGAAUGUGCUAAGGUUUCUGUGACCUUUGACCCAUUUUGCUAUCUAACGCUGCCACUGCCCUUGAAGAAAGAUCGAGUUAUGGAGGUUUUCCUGGUUCCUGCUGACCCUCACUGCAGACCUACUCAGUACCGUGUGACUGUGCCGCUGAUGGGGGCUGUGUCCGACCUGUGCGAGGCUCUCUCCAGGCUGUCUGGCAUUGCUGCAGAAAAUAUGGUGGUCGCAGAUGUGUAUAAUCACCGAUUCCACAAAAUUUUCCAAAUGGAUGAAGGUUUAAACCACAUCAUGCCUCGGGAUGACAUUUUCGUGUACGAGGUCUGCAGCACUUCCGUGGAUGGCUCGGAAUGUGUCACGCUUCCAGUCUACUUCAGGGAGAGGAAGUCCAGGCCAUCAAGCACUUCCUCCGCAUCAGCGCUAUAUGGGCAGCCACUAUUGCUUUCUGUCCCCAAGCACAAGUUAACCCUUGAGUCUUUGUACCAGGCUGUUUGUGAUCGUAUCAGCCGCUAUGUGAAACAGCCUUUACCUGAUGAGUUUGGCAGCUCACCCUUGGAGCCAGGGGCCUGCAAUGGCUCCAGGAACAGCUGUGAAGGAGAAGAUGAGGAAGAAAUGGAGCAUCAGGAAGAAGGCAAAGAGCAGCUUUCAGAAACAGAAGGCAGUGGGGAAGAUGAGCCAGGAAAUGACCCCAGUGAGACCACCCAAAAGAAGAUCAAAGGCCAGCCCUGCCCAAAAAGGCUUUUUACCUUCAGUCUUGUGAACUCCUAUGGAACAGCUGACAUAAAUUCACUUGCAGCUGAUGGAAAACUACUUAAACUCAACUCUCGAUCUACACUGGCCAUGGAUUGGGACAGUGAAACUCGGAGACUUUACUAUGAUGAGCAAGAAUCUGAGGCCUACGAGAAGCAUGUGAGCAUGUUGCAGCCUCAGAAGAAGAAGAAGACCACAGUGGCCCUGAGAGACUGCAUCGAGCUCUUCACCACCAUGGAGACCCUUGGGGAGCAUGACCCCUGGUACUGUCCCAACUGUAAGAAGCAUCAACAGGCCACAAAAAAGUUUGACCUAUGGUCCUUGCCCAAGAUCCUGGUGGUCCACCUCAAACGUUUCUCCUACAACAGAUACUGGAGGGAUAAGCUCGACACAGUCGUAGAAUUCCCAAUCAGAGGGCUGAACAUGUCCGAGUUUGUCUGUAACCUGUCAGCAAGGCCUUAUGUGUACGACCUCAUUGCCGUGUCCAAUCAUUAUGGAGCCAUGGGGGUUGGCCACUACACUGCAUAUGCGAAGAACAAACUGAAUGGUAAAUGGUAUUACUUUGAUGAUAGCAACGUGUCCCUGGCCUCUGAGGAUCAGAUAGUGACUAAAGCAGCUUAUGUGCUAUUUUACCAACGUCGAGAUGAUGAAUUUUAUAAGACACCUUCACUUAGCAGUUCUGGUUCCUCUGAUGGAGGGACACGACCAAGCAGCUCUCAGCAGGGCUUUGGGGAUGAUGAGGCUUGCAGCAUGGACACCAACUAAUGCUGACUCCACGAUCCUGCCACCCUGUAGCGCCAGUGUAAUCCCCCAGGAGAACAUCUUUGACACUCUGCAGACUGCUAGUGUUCUGUCUAAAAACCAGACAAGGAAAUACCCUUCUUUUAUGAGCAGAAGGAAACAAAAAAAAAAAAAGAAGACCGUUUACCUAGAAGAAGCUAUGUCAAGAGGCUGAAUUAUUUUUAUUUUUAAACAGGUGGUGAGAAAUUUCUGUGAAACCUGUGAAGCUGAAAAGGGGGUGGGAUGGGGGUACUCAAUGGAGUAUGUCUGAUGGAUCCCGAAGAAUGGAGAGGAACACAGGCGCUGAGUAUGGAGCAGCCUGGAGACCCACCCCACCUGCAGGGCUGCCCUGAGCGCCUGGAUUUCUGGUUCUGAUGCCAAUACUAGUCACCCCAAGUAGUCUGCUCACAGUAACCCAAACCUCAAGUAAACUCCCCUUUCCCUCGCUAUGUGCACUGAUAUGGGUUUAUAAUUUUCUGAAAGUUACCCACUGAAGCCCAUUUCUCCGUUGAGUCAUCUUGUAAUUUCCAGCUUUCUCCCCGCUAAGGAAGAUAUCUAGUGUUGGGGAUCCUGGCCCCUCAACCUCCUGUGGAACCCAGCAGUUCUGUUAUAUCCCCUGCUACCCUAGAUGAAUUAAGACGGUUAAAUACUGUGUGGAACUUUUAUUAGAUAACACACUUUUUAUUAGAUAACGCUUAAAGGAAGUCAGUACAUAAAACUGCCCGGUGCUGUGUCCCGUCUAGUUGUUUCCAUGUUGGCUUGAGAACAGAAAUCUUUGUGGGAGUUAGCCGGGAAAGGGCUCCAGUUCAUGGCGAUUUAGGGUAGUAAUACAUUUUGGUGUUACCCAGAUGCUUUCUAGAACGGGUUCUUUCCUCAUCCCUGCCAAGACUCUUCCCGGGGCCCCCAUUCGAAAGCCCCGUCCCCACUCCCACCGCGGGGCCAGCCGCUGCGUGUGGGCAAGGCCUUAAGGAACCGGACGUAUGGGUCCGGGAUUUUUUGUCUGACCUUCAACCUAAUCCGUGGGGGUUUGGGGCCUGCGCGGGGCACGCGCAUGCGAUGACCGUUGGAUGGGUCGGCGUCACUGCGCUGCGGGUGAGGACAAGGACGUGGCUGCCGACUCGCCAAAGGGGGGGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1301.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1374.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 1069.62
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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