Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_201627.3
Sequence Length
2705 nt
GC Content
0.6122
GCUUCCGGCAUCGGCUGUGGGGAGUACCGGCUGCAGUCGGCUGUGCCGGGAGGGUAGGAUGGCGUCUGGCCGAUGCGGUGAUAGCACCGAAAGCAGACGGCCGCCAGGCGCUCCCCCUACCCCCCGAAGUUUCUCCCCAGCGGCGGGGGAUGGGGGUAGGCGGUUCCUCUGUUCUUUCUGCGUUCCCCGCGGCCUCUUACCACAGAGACGCGGGCCUCCACCGUCCUAGCCCUCCCGCCCUGUUCUCUAGUGCGGACUAGAGCGUCUCCUCGCCAUUUCCUGUCGCCCUGGGGCCCCGCGGGGAAAAAGGGGGAGUAGCAGGACAGCGGAGGGAAGUCGCGAGCUUAGGUGGUGUGUAGACGCCGGAAGUGUUGGGAAGGAGGCCGGAAGCUAGGGGCGGGGCCAGGAAGUGAGGAGGGGCGGGGGUUUAUGAGGAGUCCAAGGGAGCAUUGGGGCAGACUUGUACUCAGAGCCACCUGAGGGACUUGGCGGUGGCGCCCAGCACUGUCCCCUCCCCUCGUAGAGACACGGUUGUCGUUUGGGAGUAGGGAACACUGUGUUGGGGUGGGUUGUCGGCAGGACAUCUCUCUGGCUGCUCUUGGGGCGAGGUGUGGAGGGGCAGGGCUGGGGGUGGAGCCGGGUCGCCAGGGCGUCGGUAGGGAAGACCCCCGCCCCUCGCCCCCCCACCGAACCUCUACACUGGCUGGCUGGACACUAAGAUGGCUGCCGUUGCCAUGACACCCAACCCUGUGCAGACCCUUCAGGAGGAGGCGGUGUGCGCCAUCUGCCUCGAUUACUUCACGGACCCCGUGUCCAUCGGCUGCGGGCACAACUUCUGCCGAGUUUGUGUAACCCAGUUGUGGGGUGGGGAGGAUGAGGAGGACAGAGAUGAGUUAGAUCGGGAGGAGGAGGAGGAGGACGGAGAGGAGGAGGAAGUGGAGGCUGUGGGGGCUGGCGCGGGGUGGGACACCCCCAUGCGGGAUGAAGACUACGAGGGUGACAUGGAGGAGGAGGUCGAGGAGGAAGAAGAGGGUGUGUUCUGGACCAGUGGCAUGAGCAGGUCCAGCUGGGACAACAUGGACUAUGUGUGGGAGGAGGAGGACGAGGAGGAAGACCUGGACUACUACUUGGGGGACAUGGAGGAGGAGGACCUGAGGGGGGAGGAUGAGGAGGACGAGGAGGAAGUGCUGGAGGAGGUUGAGGAAGAGGAUCUAGACCCCGUCACCCCACUGCCCCCGCCUCCAGCCCCUCGGAGGUGCUUCACAUGCCCUCAGUGCCGAAAGAGCUUUCCUCGGCGGAGCUUCCGCCCCAACCUGCAGCUGGCCAAUAUGGUCCAGGUGAUUCGGCAGAUGCACCCAACCCCUGGUCGAGGGAGCCGCGUGACCGAUCAGGGCAUCUGUCCCAAACACCAAGAAGCCCUGAAGCUCUUCUGCGAGGUAGACGAAGAGGCCAUCUGUGUGGUGUGCCGAGAAUCCAGGAGCCACAAACAGCACAGCGUGGUGCCAUUGGAGGAGGUGGUGCAGGAGUACAAGGCCAAACUGCAGGGGCACGUGGAACCACUGAGGAAGCACCUGGAGGCAGUGCAGAAGAUGAAAGCCAAGGAGGAGAGGCGAGUGACAGAACUGAAGAGCCAGAUGAAGUCAGAGCUGGCAGCGGUGGCCUCGGAGUUUGGGCGACUGACACGGUUUCUGGCUGAAGAGCAGGCAGGGCUGGAACGGCGUCUCAGAGAGAUGCAUGAAGCCCAGCUGGGGCGUGCGGGAGCCGCGGCUAGUCGCCUUGCAGAACAGGCCGCCCAGCUCAGCCGCCUGCUGGCAGAGGCCCAGGAGCGGAGCCAGCAGGGGGGUCUCCGGCUGCUCCAGGACAUCAAGGAGACUUUCAAUAGGUGUGAAGAGGUACAGCUGCAGCCCCCAGAGGUCUGGUCCCCUGACCCGUGCCAACCCCAUAGCCAUGACUUCCUGACAGAUGCCAUCGUGAGGAAAAUGAGCCGGAUGUUCUGUCAGGCUGCGAGAGUGGACCUGACGCUGGACCCUGACACGGCUCACCCGGCCCUGAUGCUGUCCCCUGACCGCCGGGGGGUCCGCCUGGCAGAGCGGCGGCAGGAGGUUGCUGACCAUCCCAAGCGCUUCUCGGCCGACUGCUGCGUACUGGGGGCCCAGGGCUUCCGCUCCGGCCGGCACUACUGGGAGGAGCCUAAAGAACCCUCCUGGCCUCCAGCUCAGCCUUCUCUCACCUACUAUGUCUGUCCAACAGACCGGCCAGAAUUUAGCUUCACUUGAGAGAGAUCUGGAAUGGUCGCCAUGAUUGAAACCACGCACCAUUACAUCAUCAUUACAUUAAUUACAUCAACAUAAAUUAUUUCUUCCCCCUUCCCUUUUCCAGCACUCAACCAAGGAGCAAAGCUCAUCCCACCCCACACCCCUCCCAGGUCUGCUCACUGCCAGGCUCCUCUCCCCUUUGUUCAGUGGAGCUGGCUUUUCUCCCAGCCCCUUUCCAUGCCUUUCACUCCAUUUGGCAAGCUCUGAGGGGGAGCCUGGGGACGGGUUUGGGUCCCCAGGAGGAGAGCCUUGGGUAUAAUCUAUUUUUCUAGGAGCCUCUUGCCUUGUCACUUGCAGCUUUCGCCCUCUGCUUUGAUGGCUGAGGUGAACUCAUGUUCUUUGGGAAAAGGGAAGGCGUGCUGUGGAAAUAAAAUGUUUAUUUGCUUCUCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1176.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1220.35
Frequency: 0.0000
Diversity: 800.07
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.((.((..(((((((.((((((((....))))))...((((.(((((((..((((((((((((.(((((((....))))....)))..)))))...)))))))...)))))))))))..))..)))))))((.((((((((((.(((.((((((.....))).))).))).)))))))))).))....((((((.(((.((((..(((((.(.(((((.((.(((((.((.....(((((((....)))))))....(((((((....((((........))))....)))))))....)))))))..))))))).).))))).....))))..)))..)))))).)).)).)))))))))(((((((.(((((((((..((((((((.((((((.((.((((((.(((((.((((.........((((((.(((..((.((((((((....))).))))).))..)))...))))))(((((((((((...((((((((.(((((.(((.((((((((....)))).)))).))).((((..(((.(.((((((((.(((...((((((..(((((.((((((((((...(((..(((((.(((.((((..((((.((((((((.((((((((.....))).))))).(((....))))))))))).)))))))).))).)))))..).))))).))))))).....))))).))))))..)))...)).)))))).).)))....))))...))))).)))))))))))))).))))).((((.....(((((...)))))...))))((((.((((((((.(((....))).))))))..))))))(((((((((((..((.((((..(((.((((..((......))((((((.(((((((.(((...((((((((((((((((.(.((((((((((..((((((((((((((.....)))))..(((((..(((((.(..(((.......((((((.((.((.....((.....((((((((((.(((((((.((.......)).)))))))......(..((((..((....((((.((....(((.(.........).)))...)).))))....))..))))..)..((((.((((..((((((.......(((((.((.((.((.((((.(((.((.((((..(((......))).)))))).)))...)))).)))))))))))..))))))..)))).))))))))))))))....))....)).))))))))((((((...)))))).....((((((((((((.....(((...((((..((....))..))))..)))(((((....((.(((((.(.((((..(((((((.(((.............))).)))))))...(((((((((..((.........(((((((.....)))).))).....((((((.((......(((.....(...(((((.(((.((..(((.((((....))))...)))...)).))).)))))...).....))).....)).)))))).))..))))))))).....(((..........)))...((((....(((......))).....))))..((((((.(.((((((((........(((((((((.(.((((((((((((....))).(((.(((((......(((((((...)))))))....))))).)))........))))))))).)..)))))))))........))))))))).)).))))(.(((((((((....((......))...))))))))).))))).)))))).)))))))(((((...((.....))....))))).....))).))))))))).)))..).))))).)))))....))))))))).)))))))))).).)))))))((((((..((.((((.......))))...))....))))))...((((.((.((((((((((.((((..........)))))).((((((.........(((....))).)))))))))))))))).))))(((((((((.((((((.(((..........)))))))))..)))).)))))..(..(((((((((.((((.(((.(((((..((((.....))))..))))).....)))))))...)))))))))..)..))))))))).))).....((((((...))))))...(((((.(((..(((.....)))..))))))))((((((.((..((........)).)))))))).....................................))))))).)))))))))))))....)))).))...((((...))))..))))))))))))))).)))....)).)))))).)).))))))...)))))......)))....))))))))).))))))).((....((((((((((..(((.....(((((...(((.((((..(((((((((........)))))))))(((((.((((((((.............)))))).))))))).)))).)))))))).((....))((((.(((.....))).)))).((((....))))....)))....))))))))))....))(((((((...)))))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({({(,((.(({{(((((((.{{(((({(..,.)))))),},((((.(((((((..((((((((((((.(((((((....))))....)))..))))},.,))))))}...)))))))))))..,...)))))))||.((((((((((.(((.((((((.....)))}})).))).)))))))))){||{{{{(,((,(,{{{.{{({{{({((({({(,((({((,(((((.(((({({(((((((....))))))|{..{(((((,,..{(((((((.(((....)))...)))))))}...,))))))..))))))),).))}))},...,},}.})}}}})))))).}..)}.)))})}})),|||||{|||||||||({(((.,(((({(((((,.(,{(((((,{((({{.,(((((({.((((((((((.(((..((.((((((((....))).))))).))..)))...))))),(((((((((((...((((((((.(((((.(((.((((((((....)))).)))).))).((((....(((({,{(((((((({,((((((((..(((((.((((((((((...({{..(((((.(((.((((..((((.((((((((.((((((((.....})).})))).{{{...,))))))))))).)))))))).))}.)))))..).,,))).))))))).....))))).)))))}....,..,)))))))}))),}})))).))))...))))).)))))))))))))),))))).......})))).})))))){||{{{..,,,,,{.||||||,,(((({.{,|||{|||},,..,||||,.(((((((((({{(({,((((.((...((((.(((((((.{{,(,,((({({{({({,{{..(((((((((,.((,((({({((((,((((({..((,(,(((((((({,,.{(||....}}}.|,....,,.,..((({(.,.(((((((((,({,.{{((.((((({{(,,(((((((.(((((((.((.......)).))))))).,,({{({{({(((.,{{,(.(((((((((((,{(.,,{{,{{({{{.|,|{{.{{{,..,.{((((..(((({{{{.(((({((((..(((((({{{....(((((.((.((.((.((((.(((.((.((((..(((......))).)))))).)))...)))).)))))))))))..,,)))),{||||{||||.|||||||||{.{(((...,|.{||||||||((,((...{{||{|,,,..{((((((,(((((....{(,(((.((((..((.,,,|},,||||..,,{{{((((({.(,{..,}.},)}})),.(((((((.(((.............))).)))))))..((((((..(......)..))))))(((((({{{{{|}|(((((.....,,{,||.|{|||,....}}}}}}.))))),||.{|},},,.}}))))}},}}}.)}...})))}..)))))))}},..)))))})).)))})))))).,||{{,|||}.|},}}....{,...(((..,.,{....|||...((((...,(((......))).}...)))}(((((({....{(((((((....,,..(((((((((.(.(((((((({{(,,.....{.(((.(((((......(((((((...)))))))....))))).)))....)..}))))))))).)..)))))))))..,....,))))))))))))))..((.(((((((((....((......))...))))))))).))}))))}}}))|||||,}},{{{|..|||}.,,}}}....))))),..,,)))}),,)),,,,)))))..})))))..)))))}..,))))),,..))))))))))},,,))))))((((({...(((({,,.{{....{{{{{{{}.||{||||||{{{((((.,,.||||,|||||}|,,|}}}.......))))))},,{{{|,,,},,}}}}||,{{,|.,.|||}|}}|}}})}))),))}}(((((((((.(((((,{(((..........)))))))))..)))).))))).....(((((((((.((((,(({.(((((..((((.....))))..))))).....),,))))...))))))))),))..)))))))))}))}}))))}),)))))..,.(((((.(((({,(((..(((.....)))..))))))))..))))),..,,{..,,.....}}))))).,,...............,,,,,...........,,,,,,))))))).)))))))))))))},)}))).......((((...)))).))))))))).).))})))))}})))).)})))).)).,,))))})})))))}}.}}}..).}}.))))))),)))),,,,)}}))},,}||,)}|||)))})))},}}}}}}|}}},|.},|))}}(((((((((........)))))))))(((((.((((((((.............)))))).))))))).)))).)))))).).))}}})))))|,.)))}},}})}).)))),{{{(....)}})..,|||,..||}||||||||,.{{{,..,|||..}}}))),})).}}}}}}.
Back