Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_201636.3
Sequence Length
1982 nt
GC Content
0.6519
AGAGACUGGACGGAGAGAGCGAGCCGCGGGCUGCCAGCGGCCCCCACCCGUCCCAGCUCGGCUUAGCCCCCGCGGACCCCUCCAGGCCGCGACCCCAGGGCGUCCUGUGCCGCCACGCCCUCCAUCUGUGUGGGUCCUCUGCUGGGCCCGCCCCUGGUCACAGCCAGACUGACUCAGUUUCCCUGGGAGGUCCCGCUCGAGCCCGUCCUUCCCCUCCCUCUGCCCGCCCCCAGCCCUCGCCCCACCCUCGGCGCCCGCACAUCUGCCUGCUCAGCUCCAGACGGCGCCCGGACCCCCGGGCGCGGGAUCCAGCCAGGUGGGAGCCCCGCAGAUGAGGUCUCUGAAGGUGUGCCUGAACCAGUGCCAGCCUGCCCUGUCUGCAGCAUCGGCCUGAUGGGGUGGUGACUGAUCCCUCAGGGCUCCGGAGCCAUGUGGCCCAACGGCAGUUCCCUGGGGCCCUGUUUCCGGCCCACAAACAUUACCCUGGAGGAGAGACGGCUGAUCGCCUCGCCCUGGUUCGCCGCCUCCUUCUGCGUGGUGGGCCUGGCCUCCAACCUGCUGGCCCUGAGCGUGCUGGCGGGCGCGCGGCAGGGGGGUUCGCACACGCGCUCCUCCUUCCUCACCUUCCUCUGCGGCCUCGUCCUCACCGACUUCCUGGGGCUGCUGGUGACCGGUACCAUCGUGGUGUCCCAGCACGCCGCGCUCUUCGAGUGGCACGCCGUGGACCCUGGCUGCCGUCUCUGUCGCUUCAUGGGCGUCGUCAUGAUCUUCUUCGGCCUGUCCCCGCUGCUGCUGGGGGCCGCCAUGGCCUCAGAGCGCUACCUGGGUAUCACCCGGCCCUUCUCGCGCCCGGCGGUCGCCUCGCAGCGCCGCGCCUGGGCCACCGUGGGGCUGGUGUGGGCGGCCGCGCUGGCGCUGGGCCUGCUGCCCCUGCUGGGCGUGGGUCGCUACACCGUGCAAUACCCGGGGUCCUGGUGCUUCCUGACGCUGGGCGCCGAGUCCGGGGACGUGGCCUUCGGGCUGCUCUUCUCCAUGCUGGGCGGCCUCUCGGUCGGGCUGUCCUUCCUGCUGAACACGGUCAGCGUGGCCACCCUGUGCCACGUCUACCACGGGCAGGAGGCGGCCCAGCAGCGUCCCCGGGACUCCGAGGUGGAGAUGAUGGCUCAGCUCCUGGGGAUCAUGGUGGUGGCCAGCGUGUGUUGGCUGCCCCUUCUGGUCUUCAUCGCCCAGACAGUGCUGCGAAACCCGCCUGCCAUGAGCCCCGCCGGGCAGCUGUCCCGCACCACGGAGAAGGAGCUGCUCAUCUACUUGCGCGUGGCCACCUGGAACCAGAUCCUGGACCCCUGGGUGUAUAUCCUGUUCCGCCGCGCCGUGCUCCGGCGUCUCCAGCCUCGCCUCAGCACCCGGCCCAGACGGAGUCUCACUCUGUGGCCCAGCCUGGAGUACAGUGGCACGAUCUCGGCUCACUGCAACCUCCGCCUCCCGGGUUCAAGCGAUUCUCGUGCCUCAGCCUCCCGAGCAGCUGGGAUUACAGGCGUAAGCCACUGCGCCCGGCCUUGCAUGCUCUUUGACCCUGAAUUUGACCUACUUGCUGGGGUACAGUUGCUUCCUUUUGAACCUCCAACAGGGAAGGCUCUGUCCAGAAAGGAUUGAAUGUGAACGGGGGCACCCCCUUUUCUUGCCAAAAUAUAUCUCUGCCUUUGGUUUUAUUUUCCUUUGGGUCCAGAAGUUUUCAAUCUCUGGAGUUUGUGCAUUGGGCCUCACCCGGAGCAGACGAGGGCAGGGCUGGGAAGGAUGGGGAGGGACAUAGAGGAUUCGGUUCCUCCCCCACCUUGUUUCUUGAGUGUUUCCUAAUCACUUGAUGGGUGGUACCACCUAGAAUUCUUCCAGCAGCCUGUAAUGGGAGGGCUACAGGUUAGCCCUGGAACCUGCAAUCAAACCACCUUUGAAUCUGUGUGUCAUUAAAAGUAGAUAUAAAUGGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-907.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -938.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 355.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.((((((((.(.(.(.(.(((((((....)).))))).))).))))).)))))))(((...)))(((((((.((......))))))....(((((((..((((((.......(((((((......((((((((......))))))))..(((((....)))))((((...))))....(((((.(((.((((((......((((((((((..(((...(((((((...(((((((.......(((((((((((((........)))..(((..(((..((((((.((((((((((((((((((.((((...(((((((...(((((((.(((((........(((((((((..(((((((((((((((((((((.((.......))..)))))))))).).)))....((((((((...((.(((....)))))..((((((.....(((((((........(((((((......(((.(.(((((((.(.((((.((..(((.......))))))))))))))))).).)))))))))).)))).)))..)))))))))))))).))))))))))))))))((.(((((((..(((....)))..)))))))))..)))))..))))))).....))).))))......))))(((((((((.(((....((((...))))))))))))).)))(((((((..((((((((.((((.......))))))))).))).(.(((((...))))).)((((((........(((((...(((.((....)).)))))))).))))))...)))))))...((((((...))))))....)))))))))))(((((((((.((((.((((.(((..((....))))).))).).)))))))))))))((.(((.....))).))(((((.....))))).((((.((........))...))))))))))).))))))..)))..)))))))))))))(((((((((((((((...(((((((((..(.....)..)))))))))...))))((((((.(((.((((((......(((..(((((((((...)).)))))))..)))...)))))))))))))))....))))))))))).(((((.(((((((((((((((((..((((.((((.(((((((((((((((((....))))))))))...(((((.(......).))))).......(((.....)))..))))))).))))((.((((....)))).)).....))))...)))))).))))))......(((((((.....(((((..(((..((.(((....))).)).)))..)))))))))))).(((((..((((..........))))..)))))..((((((.(((((((...)))))))(((...))).((((..(((((((.((....)))).)))))....))))(((((((((((((((((((((...((((((((((.....(((((((.(((......((((((......))))))...))).)).)))))........................)))))))))))))))))......)))))))......))).))))((.((((.....)))).))....(((.(((((...))))).)))...(((((..........(((...)))..........))))).((((((.(((...))).))))))((....))..))))))))))))))))....))))))).)))).))).)))..))))))))))...(((((......)))))..............(((((((.........))))))).)))))).))).)))))........(((....))).....)))))))))))))...))))))).........(((((.....))))).....((((((..........))))))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((.((((((((.(.(.(.(.(((((((....)).)))))})}).)))))))})))))(((...))){{(((((.((......)))))))...(((((((..((((((.......(((((((....{.((((((((......))))))))..(((((....)))))((((...))))....{{(((,(({.((((((,.....((((((((((..(((...(((((((...(((((((.,,....(((((((((((((.....,,.}}}..(((..(((..((((((.((((((((((((((((((.((((...(((((((,..(((((((.(((((....,..,(((((((((..(((((((((((((((((((((.((.,.....))..)))))))))).).)))....((((((((...((.(((....)))))..((((((.....{((((((........(((((((......(((.{.(((((((.(.((((.(({{({,......,)))),)))))))))))).).)))))))))).)))),))}..)))))))))))))).))))))))))))))))((.(((((((..(((....)))..)))))))))..)))))).)))))))....,))).))))......))))(((((((((.(((...,(({,..,))})))))))))).)))(((((((..((((((((.((((.{....,))))))))).))).(.(((({...})))).){{{{{{{......,|((({.((((((((....)).)))))).),)}}))),..)))))))...{{((({...))))))....)))))))))))(((((((((.((((.((((,(((..((....))))),})).).)))))))))))))((.(((.....))).)),((((.....))))}.((((.((......,.))...))))))))))).))))))..)))..))))))))))))),((((((((((((((...(((((((((..(.....)..)))))))))...))))((((((.((,{((((((......(((..(((((((({...,).)))))))..)))...)))))))))))))))....))))))))))|.(((((,(((((((((((((({,({{(((({((((.(((((((((((((((((....)))))))))).,.(((((.(......).))))).||.,..(((.....))),.))))))).))))((.((((....)})).)).....}},,.}})))))).))))),....{.(((((((.....((({(,,({{.|{(|,,{.,.}))).,,.}}}..)))))))))))),(((((..((((..........))))..)))))..((((({,(((((((...))))))){{{,..}}}.((((..(((((((.((....)))).)))))....))))(((((((((((((((((((((...((((((((((.....(((((((.(((......((((({.,....)))))).}}))}.)).)))))...,....................)))))))))))))))))......)))))))......))),})))((.((((.....)))).))....(((.(((((...))))).)))..|{{{{,....,,,,,,|||}},))}........,,..,))}((((((.(,.....,,,)))))),|.,.,||.|||||}},}})))))})},,.))))))).)))).))).)))..))))))))))...(((({...,,.}))))..............{{(((((.,....,,.))))))),)))))).}}).))))}......,.{{{,,..,}}....,)))))))))))))...)))))))......,,.(((({.....}))))...|||(((((.......,,.)))))}...))}
Back