Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_202470.3
Sequence Length
1777 nt
GC Content
0.6528
GGUCUGGAGUUUGCGGAGGGCCGAGCCGGGUGCGCACGGGGAGGCGGAGGCAGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGAGCAGAUCUUCUGGUGACCCCACUUCUCGCUGCUCAUGCCGCUGGGACUGGGGCGGCGGAAAAAGGCGCCCCCUCUAGUGGAAAAUGAGGAGGCUGAGCCAGGCCGUGGAGGGCUGGGCGUGGGGGAGCCAGGGCCUCUGGGCGGAGGUGGGUCGGGGGGCCCCCAAAUGGGCUUGCCCCCCCCUCCCCCAGCCCUGCGGCCCCGCCUCGUGUUCCACACCCAGCUGGCCCAUGGCAGUCCCACUGGCCGCAUCGAGGGCUUCACCAACGUCAAGGAGCUGUAUGGCAAGAUCGCCGAGGCCUUCCGCCUGCCAACUGCCGAGGUGAUGUUCUGCACCCUGAACACCCACAAAGUGGACAUGGACAAGCUCCUGGGGGGCCAGAUCGGGCUGGAGGACUUCAUCUUCGCCCACGUGAAGGGGCAGCGCAAGGAGGUGGAGGUGUUCAAGUCGGAGGAUGCACUCGGGCUCACCAUCACGGACAACGGGGCUGGCUACGCCUUCAUCAAGCGCAUCAAGGAGGGCAGCGUGAUCGACCACAUCCACCUCAUCAGCGUGGGCGACAUGAUCGAGGCCAUUAACGGGCAGAGCCUGCUGGGCUGCCGGCACUACGAGGUGGCCCGGCUGCUCAAGGAGCUGCCCCGAGGCCGUACCUUCACGCUGAAGCUCACGGAGCCUCGCAAGGCCUUCGACAUGAUCAGCCAGCGUUCAGCGGGUGGCCGCCCUGGCUCUGGCCCACAACUGGGCACUGGCCGAGGGACCCUGCGGCUCCGAUCCCGGGGCCCCGCCACGGUGGAGGAUCUGCCCUCUGCCUUUGAAGAGAAGGCCAUUGAGAAGGUGGAUGACCUGCUGGAGAGUUACAUGGGUAUCAGGGACACGGAGCUGGCGGCCACCAUGGUGGAGCUGGGAAAGGACAAAAGGAACCCGGAUGAGCUGGCCGAGGCCCUGGACGAACGGCUGGGUGACUUUGCCUUCCCUGACGAGUUCGUCUUUGACGUCUGGGGCGCCAUUGGGGACGCCAAGGUCGGCCGCUACUAGGACUGCCCCCGGACCCUGCGAUGAUGACCCGGGCGCAACCUGGUGGGGGCCCCCAGCAGGGACACUGACGUCAGGACCCGAGCCUCCAGCCUGAGCCUAGCUCAGCAGCCCAAGGACGAUGGUGAGGGGAGGUGGGGCCAGGCCCCCUGCCCCGCUCCAAUCGGUACCAUCCCCUCCCUGGUUCCCAGUCUGGCCGGGGUCCCCGGCCCCCCUGUGCCCUGUUCCCCACCUACCUCAGCUGGGUCAGGCACAGGGAGGGGAGGGAUCAGCCAAAUUGGGCGGCCACCCCCGCCUCCACCACUUUCCACCAUCAGCUGCCAAACUGGUCCCUCUGUCUCCCUGGGGCCUUGGGUUCUGUUUGGGGGUCAUGACCUUCCUAGUUUCCUGACGCAGGGAAUACAGGGGAGAGGGUUGUCCUUCCCCCCAGCAAAUGCAAUAAUGCCCUCACCCCUCCUGAGAGGAGCCCCCUCCCUGUGGAGCCUGUUACCUCCGCAUUUGACACGAGUCUGCUGUGAACCCCGCAACCUCCUCCCCACCUCCCAUCUCUCCUUCCAGGCCCAUCCCUGGCCCAGAGCAGGAGGGAGGGAGGGACGAUGGCGGUGGGUUUUUGUAUCUGAAUUUGCUGUCUUGAACAUAAAGAAUCUAUCUGCUGUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-855.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -881.85
Frequency: 0.0000
Diversity: 464.18
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...((((.((((((.((((.(((((.((.((.(.((((((((((((((.(.(((.((((((((.((.(((((.((.(((.((.((((((.......((((....)))).....))))))...((((((((...((((((.(.......).)))))).))))))))....((.((..(((((((.((((.((((((.((.(((.((((((..((.(((((...((((.(((((.(((..((.((((((......)))))).)).)))))))))))))))))))..))))))))))).))))))......(((((((..((((((.....((((.((...(((((((((.((........))........(((......)))))))))))).))..))))))))))..((((........))))........((((...)))).(..(((.....)))..).))))))).((((((((((((.(((.....((((((((((((.((((((((.(......((((.((((....((((.(((......))).)))))))).))))........).))))(((..((((((...............)))))))))(((......))).....)))).))).)))))))))((((.((((((((......((((((..(((..(((((.(((((((((....))))..))))).))))))))..))))))(((((((((..(((((...)))))...)))..))))))...)))).)))))))).....(((((.((((.((((((((((((..(((((((((((....((.(((....))).))..((((((.(((((((....)))))))((((....))))((((((((((.(((((((((.....)))))).....))).)))))))..)))(((....)))..)).))))....))).).))))))))))))))))).)).)))))))))..((((.((((.(..((((((.......(((....)))(((......)))))))))..))))))))).((((((((((..(((((((....(((((..(((.((((.....))))))).((((.((((((((..(((.(((((................))))).))).)))))))).)))))))))))))))))))..)))))))....))))))))))))))))))).)))))))..)))).((((.(.((.(((((((((((((((.(((...))))))))))).............)))))))))).))))(((((.((((...((((((...((((((((((((.((...((((.((.....)).)))).))))))))))).)))..)))))).)))).))))))).))).)).))))).)).))..............))))))...))).).))))))))))))))).)).)).))))).))..((((((....))))))...((((((((...))))))))...((((.(((((....)))))))))(((((...(((....))).((((.......)))).((((....)))).(((((((........)))))))...(((....))))))))....)))))))).))))...)).((((((.((((((((((..((((.......))))..))..))))))))))))))...(((((((((((((((((((.((.((........))..)))))...)))))))).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((...((((.((((((.(({{,(((((,((.((.(.((((((((((((((,(,{((,((((((((,((,(({(({((,(({(({(((((((.....,,{{{{.,,,)}))..,,,)))))}.})))))|{(({,,((((((.(.......).)))))),||}.{{{{,,,.{|,||{(((.{{{{|{{(({((((,{{(({(((.({(((({,(,{{((((,.{{(((,(({((.(((..(({(((({(,,....)))},,,))))))))))))))}))))}),||)))|)|))}|}.}})))).}}},|||{{{|},|||}|||,))}.{||||||..,{{|{{((((((((.((((..((.(((((..(((......))),.((((((((((.(((({..{|{{{..(((.(((((........))))).,}}}...,))).},})).)}.))....))))))))...,{((((((((((.(((.....((((((((((((.((((((((.(..,...((((.((((....((((.(((......))).)))))))).))))...,....).))))(((..((((((...............)))))))))(((......))).....)))).))},)))))))))((((.((((((((......((((((..(((..(((((.(((((({((....)))),,))))).))))))))..))))))(((((((((..(((({...}))))...))),.})))))...))))}}))))))).....(((((.((((.((((((((((((..(((((((((((,....|}|||...,}||.}||,,((({{.(((((((....)))))))(({(..,,||||,{{(((((((,(((((((((.....)))))).....))}.)))))))..}))|||}...,},..},.)))).,}.))).}.))))))))))))))))).)).))))))))){,((((.({((((..((((((..,.,{{(((....))).,|}.,...}},))))))..))))))))),((((((({{{..(((((((....((((({,(((.((((.....))))))},{(((.((((((((..(((.(((((.............,..))))).))).)))))))).))))))))))))))))}}}..)))))))....)))))))))))))||{|,..)))),)))))))...)))).))))))}}(({||{((((||{((...)))))))))))))....||,.||.||||||||||||,,,}}}}...(((((((...))))))).((((((((({((...((((.((.....)).)))).))))))))))).||||,,||,||.|||...,}})))))))..)}))))),)).}),.},,}},}.....))))))...))).,.))))))))))))))).)),)).))))).}}..((((({....}}}}|}|,.((((((((...))))))))...((((.(((((....)))))))))|{(({...{{,....})).{{{{.......}}}),||{|...,)}}}.(((((((........)))))))...(((....))),}})),}..)))))))).))))...)).((((((.((((((((((..((((.......))))..))..))))))))))))))...((((((((((((((((({{.{{.{{........}}..}}}}}..})))))))),))))))))
Back