Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_203286.2
Sequence Length
1909 nt
GC Content
0.6401
AAAGAGAGCGAGAGCAGCGAGCGCGGCUCCACAUUGUUGCGGAUCGCCGGCACCCGGCAGAGCGGCGGCGGCUGGGACGCGCGGCGCCUCCGACCCGUUCUCCUCGCGCCCGGCCGCGCAGCCAGAGCCACCCGGGCCGCCGACCGCCGAGCCCCGCGCCCGCCGCCUGGGCCCCGAGCCUUCUGCGCCGCCCGGGUGCGUCCCGCCACCCUCGGAGGACGGCCGGCCAUGGACGCCUGCAAGUUGGAGCCGAGCGGGAGGGUGUGAGCGGGCCGGGGCCAGGAGCCCGCGCCGCGCAACCGGGCAGCCGGGCGCGCCGGGGGUGGGUCCCUCUCCCCAGCCCCGCUCUGCGUGGAAGAAGAGGGCGGGGACCGGCGCCGGGAGGAGAGCGGAGGAGGCGAAGGGGCAUGACUCGUGCAACUUGCGGCGGGCAUCUGCCGAGCCUCUGAGCCGGCGGCGGCCCGGGGCCCGGACUGCGGCCGCGCGGAUCCCACCCAGCCCACCCCGCCCCGGCCGACGGCUGCAGCUGACCUGGAUCCUUCGAGCGCCCGCCGACCGCCAGCGAUCUUCCCUCAUCUUCCGGGCUGGUUUCUGCUGCGCGAGGAGCGCUGCCCUCGCCGCCCCUCUCGCCGGACCCCCGGCCCCCGAUGGCUCGGAUGGGGCUUGCGGGCGCCGCUGGACGCUGGUGGGGACUCGCUCUCGGCUUGACCGCAUUCUUCCUCCCAGGCGUCCACUCCCAGGUGGUCCAGGUGAACGACUCCAUGUAUGGCUUCAUCGGCACAGACGUGGUUCUGCACUGCAGCUUUGCCAACCCGCUUCCCAGCGUGAAGAUCACCCAGGUCACAUGGCAGAAGUCCACCAAUGGCUCCAAGCAGAACGUGGCCAUCUACAACCCAUCCAUGGGCGUGUCCGUGCUGGCUCCCUACCGCGAGCGUGUGGAAUUCCUGCGGCCCUCCUUCACCGAUGGCACUAUCCGCCUCUCCCGCCUGGAGCUGGAGGAUGAGGGUGUCUACAUCUGCGAGUUUGCUACCUUCCCUACGGGCAAUCGAGAAAGCCAGCUCAAUCUCACGGUGAUGGCCAAACCCACCAAUUGGAUAGAGGGUACCCAGGCAGUGCUUCGAGCCAAGAAGGGGCAGGAUGACAAGGUCCUGGUGGCCACCUGCACCUCAGCCAAUGGGAAGCCUCCCAGUGUGGUAUCCUGGGAAACUCGGUUAAAAGGUGAGGCAGAGUACCAGGAGAUCCGGAACCCCAAUGGCACAGUGACGGUCAUCAGCCGCUACCGCCUGGUGCCCAGCAGGGAAGCCCACCAGCAGUCCUUGGCCUGCAUCGUCAACUACCACAUGGACCGCUUCAAGGAAAGCCUCACUCUCAACGUGCAGUAUGAGCCUGAGGUAACCAUUGAGGGGUUUGAUGGCAACUGGUACCUGCAGCGGAUGGACGUGAAGCUCACCUGCAAAGCUGAUGCUAACCCCCCAGCCACUGAGUACCACUGGACCACGCUAAAUGGCUCUCUCCCCAAGGGUGUGGAGGCCCAGAACAGAACCCUCUUCUUCAAGGGACCCAUCAACUACAGCCUGGCAGGGACCUACAUCUGUGAGGCCACCAACCCCAUCGGUACACGCUCAGGCCAGGUGGAGGUCAAUAUCACAGCUUUCUGUCAACUUAUCUAUCCGGGCAAAGGGAGGACAAGAGCUAGGAUGUUCUGAGGAGAGACUUCACCUGGGACGUGAAAGGAGCAUGGGCUUGAUGUCAGACAGCUGUGACCCUGGACAGGGCCCCCCCCACCAUCUGUAAAACGGGGACAGUAUGAUGUACCUUGAAGGGCUGUUGUCAGAAUUCUACGUGAUGUAAGUCAAGCACCUAGCACAGAUCAGUCUGUCAAUAAAUGGCCAAUGUUCCGUGAUUAUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-813.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -845.40
Frequency: 0.0000
Diversity: 593.23
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((((..(.((.(((((((((((.((....)).)))..))))....(((((((((.((((((((...((..(((((((((...((.((((((((((((.(((.((((....(((((((.((...(((((((((((.((.(((((....(((..(((.((((((((..((((....)).))..)))))))))))...)))....))))).)).))).))))).)))..)))))...))))..)))).))).)))))...))))))).))((((.....)))))))))))))..))((((((((...((((((((((.((((........)))).)))))((((.(......).))))(((((((((((((.((((((((.(((.(((((((((((((..(((((...)))))..))).((((((((..((((..((((((.(.(((((.(((((....((((..((((((((....))))).)))......))))...))))))))))))).)))))))).....((.((....)).)).))))))))..)))).....))))))))).))))))))))))))))))))))))))....).))))))))))))))).)))).))))).((..((((.((((..(((((.....)))))..)))).))))..)).)))).))..)..))))))))).(((((((.(((((..........(((.(((((.(((..(((((((((...........(((((.(((((.....))).)).)))))(((((((..((.((((((((((...((((....))))....((((.....))))...))))))............)))).)).)))))))((.((((((...(((((.((.(((((((.(((((((.((((((........))))(((.((..(((((((((((.....((((((..((((((((((.((.((((.....))))..)).))))...)))))).........(((((.(((..((((((...))).....)))..))).))))).......)))))).))))....(((.....))).....(((((((.((((..........((((....((((..((((.......((((((((....(((.(((((.((((...((....))((((((.(......))))))).....))))...)))))))).....)))))))).))))....))))..))))...(((.((((.....)))).))).))))))))))).)))))))..)))))..((((........))))............))))))))))))..........((((((..((((((.....)).))))..))))))..)))).)).))))).)))))).))((((((...(((.((.(((..((..((((((.((....)).))).))).))...))).)).))).)))))))))))))))(((....)))...........))).))))).))).(.(((((..((((.....((((((....((((((((...((((.(((((........))))).)))).....(((((((((((..........))).))))).))).....((((((((.((((.((.(((.(((.(((........)))))).)))..((...(((((((.(((.((....)).))))))))))...))((((....))))..)).)))).))))))))((((....))))....((((..............))))..))).)))))..))))))))))))))).).............)))))..)))))))......(((.((.((....((((.....))))...)).)).))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(({{((({({{({(({,{({(((((((,((,..{||,|||.,||{{{...|||||,{{(.(((((((({{{((.{((({(({({...{{.{{{|{,{,||,|}|||}||||}}},|.|||((,((,,,({{((((((((.((.(((((....(((..(({{((((((((..{(,({...,,}))..)))))))))))...)))....))))).)).)))}})))).|||.,|||||{..|||||.}|||.|||{|||||.,,|||||||,}|(((,.,{{.||||||}||||||..||((,,,,||}}.,||||{{||{}||||,.}},..}))),})))))|||,,|......,.,}}}(((((((((((((.((((((((.(((.(((((((((((((..(((((...)))))..))).((((((((..((((..(((({{.(.(((((.(((((....((((..((((((((....))))).)))......))))...))))))))))))}.)))))))).....((.((....)).)).))))))))..)))).....))))))))).)))))))))))))))))))))|||||{{{.|{,,,))))))))))))}))))}))}||.{{,|((((.((((..(((((.....)))))..)))).)))).,||{||||||,{{{{,,,,|}}}}|{(,,{{{|,|{,,,..}}}}}}},|||}||||{.,,,.|((((((({({((.,,,{{,((((((.(((((.....}}}.}}.}}}}||,|,.(({.,,{{(((((((,,.,,((((....}))},|,.,.||.{{{{||||{|||||.||,.||,|,||,.{((({....((({...(((((((((.,,..((({....}))).,|({((,{,{((((({.,..{{{{|,.,,|)))).,,{((((,{((({((..{{{(((,,(({{{(((((.((.((((.....))))..)).))))|.,||||}}..,,,,...(((((.(((..((((((...))).....)))..))).))))).....,,}))})},|||,...,||,,,..,}))...}}}|}|.||}}}}.,}},,...}})))},}.}.)))){((((......)))))))))))))}}})).....})))}.}||||.|||},}}|{|||||...}}}))}..,,{{|||,...(((((((((((.(((((((..{..{,,(((((((,{(((...{((((((((,..,,((({..||.{|{((((((((....))).....))))))}.}}...}))}.)).)))))),,}}.||....}},|,.,,{{{{||...((((((..((((((.....)).))))..))))))..))}))},)))))))..,},}..))))))))))).(((......)))....)))))))}}}}))})).})}........|||}.,)))})).})})))))))))|}}...,)))},,.,,,,},.))),))))),)))...,,,{{..||||,,.{{((((((....((((({{(...{((({.(((((...((((.((((..(({.,.(((.(((((,,.{.(,({.((,..(((((((((({((,(((((..((((((.((((..(({.,({..,,.},...,))}..))))))))))..)))))|{{....}}}))))))))))))},)})),..,},,}))))).))).})))..)))).)))).)))))..}}))}},,{(({,..............))))..})).)))))..)))))))))||||||{,|{{....|,..,,|}|}}..)))}}}).....||{{|{{.,,.}}}||||.....}))),..)),))})),.}}....
Back