Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_203365.4
Sequence Length
2735 nt
GC Content
0.4644
CCAGUCAGUCAGUCAGUCAGUCAGUCAGUCAGUCAGUCAGUCACUGAGCGCGCGGCGCGGGAGCUGCUGGCAGUCGCUGCGUCUCUGGCGAGGGAGCGCCGCGCCUGGGGAGGAGGCGGAGGCAGCGGCUGGAGGAGCGCGAGCGGCGGUUUCCUUGCCCGGGGCCGCGGGAAGGCCGACCGACUGCCGCGAUGGAGCAGCUAUCAGAUGAAGAAAUUGAUCAUGGUGCUGAAGAAGACAGUGACAAGGAAGAUCAGGACCUGGACAAAAUGUUUGGAGCCUGGCUUGGAGAACUAGACAAACUCACUCAGAGUUUGGAUUCUGACAAGCCCAUGGAACCAGUAAAAAGAUCUCCUCUUCGCCAGGAAACAAACAUGGCCAACUUUUCUUACCGCUUCUCCAUAUACAACUUGAAUGAAGCUCUGAAUCAGGGAGAGACUGUGGAUCUGGAUGCCUUGAUGGCUGAUCUUUGCUCUAUAGAGCAGGAGCUCAGCAGCAUUGGUUCAGGAAACAGUAAGCGUCAAAUCACAGAAACGAAAGCUACUCAGAAAUUGCCUGUUAGCCGACAUACAUUGAAACAUGGCACCUUGAAAGGAUUAUCUUCUUCAUCUAAUAGGAUAGCUAAACCUUCCCAUGCCAGCUACUCCUUGGACGACGUCACUGCACAGUUAGAACAGGCCUCUUUGAGUAUGGAUGAGGCUGCUCAGCAAUCUGUACUAGAAGAUACUAAACCCUUAGUAACUAAUCAGCACAGAAGAACCGCGUCAGCAGGCACAGUGAGUGAUGCUGAAGUACACUCUAUUAGUAAUUCCUCCCAUUCCAGCAUCACUUCCGCAGCCUCCAGCAUGGACUCUUUGGAUAUUGAUAAAGUAACACGCCCUCAAGAGCUGGAUUUGACACAUCAAGGGCAGCCAAUUACUGAGCAUGCUAUUUCUCUGAGAUGUUCCAGCAAGCAGGCCAAGCGUCAUAUUGACUUCACAGAAGAACAGGCUGAGCUGACACCUCACUCCUAUCUGGACAGGGAAACCUCCCUUCUUCUGAGAAACAUUGCAGGAAAACCUUCUCAUUUGCUGACCAAGGAAGAACAGGCAGCAAAAUUGAAAGCUGAGAAGAUCAGAGUUGCCCUAGAGAAAAUUAAAGAGGCACAAGUGAAAAAGCUGGUGAUCAGAGUCCACAUGUCUGAUGACAGUUCUAAAACAAUGAUGGUGGAUGAGAGGCAGACAGUAAGACAAGUACUGGAUAACCUGAUGGACAAAUCCCACUGCGGUUAUAGUUUAGACUGGUCACUGGUAGAAACCGUUUCUGAAUUACAAAUGGAGAGAAUCUUUGAAGACCAUGAAAACUUGGUUGAAAAUCUUCUUAAUUGGACAAGAGAUAGCCAAAACAAGCUUAUAUUUAUGGAGCGUAUAGAAAAAUAUGCACUUUUCAAAAACCCACAGAAUUAUCUUUUGGGGAAAAAAGAAACAGCUGAGAUGGCAGAUAGAAACAAAGAAGUCCUCUUGGAGGAAUGUUUUUGUGGAAGUUCUGUAACUGUACCAGAAAUUGAAGGAGUCCUUUGGUUGAAGGAUGAUGGCAAGAAGUCCUGGAAAAAGCGUUAUUUUCUCUUGCGAGCAUCUGGUAUCUACUAUGUUCCCAAAGGAAAAGCAAAGGUCUCUCGGGAUCUGGUGUGCUUUCUCCAGCUGGAUCAUGUCAACGUUUAUUAUGGCCAGGACUAUCGGAACAAAUACAAAGCACCUACAGACUAUUGUCUGGUGCUGAAGCAUCCACAAAUCCAGAAGAAAUCUCAAUAUAUCAAAUACCUUUGUUGUGAUGAUGUGAGGACACUGCAUCAGUGGGUCAAUGGGAUCCGCAUUGCAAAGUAUGGGAAGCAGCUCUAUAUGAACUACCAAGAAGCCUUGAAGAGGACAGAGUCAGCCUAUGAUUGGACUUCCUUAUCCAGCUCCAGCAUUAAAUCGGGAUCCAGUUCUUCCAGCAUCCCAGAGUCUCAGUCAAACCACUCCAAUCAGUCUGAUAGCGGAGUUUCUGACACCCAGCCAGCAGGACACGUCCGUUCCCAGAGCAUUGUGAGCUCCGUAUUCUCUGAAGCCUGGAAACGAGGCACUCAGUUGGAAGAGUCCAGCAAGUAAAACAAAUGUAAAGAAUGUCCCCCCUUUACCUGCAUUGCUGGACUUCUGUGCAUGUUGGAUGCAAUUGUCUCACACCAACACGAGUGUGUGUGUCAAGCUUAUUCAUUCCUGUGUGACUGUGCACGCCUGCUCAACAUUCUCAUACUCUCCUGUGUCAGCUUACUAGCAUCAAAAAGCCAUCCUCAUUCCACCAGGAAGCCCUCCUAAACCCAGUUAUAGCAUCUGCUUGAUGUGGAUGCAGUCAUGGACUGAAAGGUAAACUGGAGCCAUCACAUCUCCCCUUGGAAGUCCAGUGCUCAGAGGACCGCCACAGAGGGUUCCAUGUAGGGCAGGCUGUGUCAAAGUCAUACAGCCAAGGUCAGAAGUCAUGCAUCCUGUCACCAUUCAAACAGCUUUUGCAGCCGGACAUUUUUCCUAGAUUGUUAGAUGGUCUAGCUAUUUUACUGUGGGGUAAAACAAGUUUUCUGUUUCCUUCUUGCCCGCACAAUCAGAUUUUAGCCUUCCUGACAUUGUCCAUCUUUAUGAUCACCACCAACUUCUGCAUCCUUUUCAUGCAUGUCCCAGACUCCCUGCUUUUUAGUUUUACACAAUCAAAGCUUACCUCUGUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-812.87 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -865.10
Frequency: 0.0000
Diversity: 564.26
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((.(((..((((.(((((..(..((((..(((((.((((..(((.((.....)).)))..)))))))))....))))..)..))))).(.(((((..((((((((((((.(.((((....(.((((((((..(..((((.(((((((((.((((.((((......))))))))..))))).))))))))..(((((.((((((((((......((((....((((..(((...((((..((....((((((.(.((((((((....((((((.(((((..((((((.((((.....(((((((.....)))))))..))))..)))))).....................(((((((((((((........).))))..............(((((.((((((....(((.....)))(((((...))))).((((((.(((((.(((((((.......(((((.((((((((....))))).))).))))).....((((((.((..(.(((((((((.......((((((((....((((.(((....(((((.(((.((..(((.(((((.....(((((....(((.((.(((.((((((........)))).)).))).)))))...))))).........(((((...((((((((....(((......((((((((((.......((.(((.((((.....(((((.((.((((.((((((....)))))).))..)))).)))))........((((((((((...(.(((((((((((...............................))))))))))).)...)))).((((.((..((.((((((..((((((.......(((((((.....((((((....(((..(((((((((((((.....)).)).))))....)).)))..)))))))))....)))....))))..))))))..)).))))))..)).)))).)))))).......(((.....))).(((((....)))))..(((((.((....)).)))))....((((((((((((((.((...........))))))))).........)))))))....)))).))).)).......)))))))))).....)))....)).))))))....)))))..((((....)))).........))))))))..)).))).)))))........(((.(((.((((((((((..((((.......))).)..))))...))))))))).))).)))))))....)))))))).........(((((((..(((....)))(((((((((((((.(((...((((.(((........)))))))...)))..)))).))...))))))).((((((......)))))).)))))))....(((.(((((.....))))))))......((..(((((((((.((((.(((((((((((((..(((((...)))))...))))))).....)))))).....(((((((..((((..(((.((((((.((...(((((.(.((((((......(((((........))))))))))).).)))))(((....)))...((((....)))))).)))))).)))))))..))))))))))).))).))))))..))......))))))))).)..)).))))))...............((((((...((((....))))))))))...)))))))...)))))..))...))))..((((.((((....)))).)))).((((((.((....))))))))(((((((.....)))))))........))))))))))).(((((...((......)))).)))...))))))))...(((((.....)))))(((........))).)))))))))))...))))).))).).)))))).......))..))))...))).))))...))))..))))))))))...)))))...)..)))))).)).)....))))).))))))).))...))).))))).).((((((((.((((.(...).))))..))))..))))((((((((((((((........((((((..........)))))).))).)))))))))))..(((((((..(((((((.(((.(.((((((.......).))))).).)))............((((((((((.(((((((((((((.((((......((((((.((((...(((....)))........((..(((((........((((.....)))).............((((((((.....))))))))(((..((((((..((((......((((.........))))))))...))))))..)))..)))))..))))))))))))...)))).)))))))).))).)).))))))))))...(((..(((.(((.((((..((((..........))))....))))....))).)))..))).((((((.((((((.(............((((((((((((((.......))))......)))))).)))).((((............))))....).))))))..))))))............)))))))....)))))))......))))..)))))....((((((........))))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,((.{((,,{(((.({(((.,{{.({((,.(((((.((((..(((.((.....)).)))..))))))))).,..)))),.,..))))).{.(((((..(({(((((((((.(.((((..,.{.((((((((.,(..((((.(((((((((.((((.((((......))))))))..))))).))))))))..(((((.((((((((((.......(((....(((({{(((...{(((..((....((((((.{.((((((((....(((({{{(((((..((((((.((({..,..(((((((.....)))))))..))))..))))))...{{,.,,,,,.......,,(((((((((((((........).))))..............(((((.((((((....(((,,...},,{{{{{..,))))|,((,,{(.(((((.(((((((.,,..,,(((((.((((((((....)))))}})).)))))..|,.((((((.((..(.(((((((((.......((((((((....((((.(((...,(((((.(((.((,.(((.(((((.....(((((....(,((((.(((.({{{{{........}))).}).})}.)))),...))))),.,......{((((...((((((((....(({......((((((((((....{,,{({(({{((((,{,..(((((.((.({((.((((((....)))))).))..)})).)))))......({,,,.||{(((...(.(((((((((((.{,,.......................,}}.))))))))))).),,.)))),((((.{{..{({({(((,..{({{,,.,||,..,,((({{.....((((({....{{{..(({{{((((((({.....)).)).)))}....|},}}},,)))))))))..,.})),...))||{.,}}))),,||.||}||},.}}.)))),))})}}.}}}}}.|||..,,,}},.(((({....})))}|||||||,|,.....,,,|||,...,||{|{({(((((((.((..,......,.)))))))))...,,...})}))))),...)})).,))}),,,,....)))))))))).....)}}....)).))))))....))))}..((((....)))),,.......)))))))).,)).))).))))),.......(((.(((.((((((((((.,,(((.......))).,..))))}..,)))))))).))).)))))))....)))))))).........,{(((({..,||{{..,{{((({{{{..,{|||||{...|{{||{{{....,,..}}}}}}},||}}}..,,,),},...}}}}}}},({((((,.....}))))).}))}}}}....(((.(((({.....))))))))......((..(((((((((.((((.(((((((((((((.,(((((...))))).}.))))))).....)))))).....(((((((..(((,.,(((.((((((.((...(((((.{.((((({.,....,({{{........}}}}))))))).}.))))|{({....})},..{(((....)))))).)))))).)))))))..))))))))))).)))}})))))..))......))))))))).)..)).))))))...............((((((...((((....)))))))))).,.)))))))...))))).,,}...))))..,{{(,((({....,})),)})},|({{((,{{....)}|)))),(((((((.....)))))))..,,,...))))))))))).(((({...,|......,})),,))...))))))))..,|{{{{.....}}))}||,.,,,}...}}},)))))))))))...))))).))).}.))))))....,..}}..))))}}})},.))))...})))}.))))))))))...)))))...}..)))))).)).,,...))))).))))))).))...)}).))))).,.,{{|((((.((((,|...).))))..))))..))}|((((((((((((({........((((((..........)))))).))).))))))))))),|(((((((..(((((({.{((.{.((((({.,{....)}))))),).)},,...........((((((((((.{((((((((((((.((((......((((({,((((...(((....)))........((..(((((.,,,{...,|||,....,,}}.............((((((((.....))))))))(((..((((((..((((......((((.........))))))))...))))))..)))..)))))..))))))))))))...)))).)))))))).))),}}.))))))))))....{{{{{{{{({,.{({{..{(({..........}}}),...)))},,.((({,....,}}..{{,((({(({.((.{{{{..({({...((((((((((((({,{....,)))),.....}))))).))))...}))}.}))))).}.}))))}.})}}}{{|....,))}.........,...)))))))....))))))),.....))))..)))}}....{(((((........)))))}.......,...
Back