Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_203401.2
Sequence Length
1606 nt
GC Content
0.4620
AUUGUCUGAAGGGACGGGGCGGUGCCCCAGGGACCAGCGGCUUUAGGACCAAACUGCGGGCAGCCAGGGCCGCGACCCUCCCUGCGACCGUCCCCUGGCGACCGCAGCUGGUGAUUGAGGGGCGGCGCUCCCGGGCCCCACGAGGGUUCUUCUGUCUUCGCGGCCGGACGCGCGGACAGCGUGGGUGGCGGCAGGACUUUCCUUAUCCCAGUUGAUUGUGCAGAAUACACUGCCUGUCGCUUGUCUUCUAUUCACCAUGGCUUCUUCUGAUAUCCAGGUGAAAGAACUGGAGAAGCGUGCCUCAGGCCAGGCUUUUGAGCUGAUUCUCAGCCCUCGGUCAAAAGAAUCUGUUCCAGAAUUCCCCCUUUCCCCUCCAAAGAAGAAGGAUCUUUCCCUGGAGGAAAUUCAGAAGAAAUUAGAAGCUGCAGAAGAAAGACGCAAGUCCCAUGAAGCUGAGGUCUUGAAGCAGCUGGCUGAGAAACGAGAGCACGAGAAAGAAGUGCUUCAGAAGGCAAUAGAAGAGAACAACAACUUCAGUAAAAUGGCAGAAGAGAAACUGACCCACAAAAUGGAAGCUAAUAAAGAGAACCGAGAGGCACAAAUGGCUGCCAAACUGGAACGUUUGCGAGAGAAGGAUAAGCACAUUGAAGAAGUGCGGAAGAACAAAGAAUCCAAAGACCCUGCUGACGAGACUGAAGCUGACUAAUUUGUUCUGAGAACUGACUUUCUCCCCAUCCCCUUCCUAAAUAUCCAAAGACUGUACUGGCCAGUGUCAUUUUAUUUUUUCCCUCCUGACAAAUAUUUUAGAAGCUAAUGUAGGACUGUAUAGGUAGAUCCAGAUCCAGACUGUAAGAUGUUGUUUUAGGGGCUAAAGGGGAGAAACUGAAAGUGUUUUACUCUUUUUCUAAAGUGUUGGUCUUUCUAAUGUAGCUAUUUUUCUUGUUGCAUCUUUUCUACUUCAGUACACUUGGUGUACUGGGUUAAUGGCUAGUACUGUAUUGGCUCUGUGAAAACAUAUUUGUGAAAAGAGUAUGUAGUGGCUUCUUUUGAACUGUUAGAUGCUGAAUAUCUGUUCACUUUUCAAUCCCAAUUCUGUCCCAAUCUUACCAGAUGCUACUGGACUUGAAUGGUUAAUAAAACUGCACAGUGCUGUUGGUGGCAGUGACUUCUUUUGAGUUAGGUUAAUAAAUCAAGCCAUAGAGCCCCUCCUGGUUGAUACUUGUUCCAGAUGGGGCCUUUGGGGCUGGUAGAAAUACCCAACGCACAAAUGACCGCACGUUCUCUGCCCCGUUUCUUGCCCCAGUGUGGUUUGCAUUGUCUCCUUCCACAAUGACUGCUUUGUUUGGAUGCCUCAGCCCAGGUCAGCUGUUACUUUCUUUCAGAUGUUUAUUUGCAAACAACCAUUUUUUGUUCUGUGUCCCUUUUAAAAGGCAGAUUAAAAGCACAAGCGUGUUUCUAGAGAACAGUUGAGAGAGAAUCUCAAGAUUCUACUUGGUGGUUUGCUUGCUCUACGUUACAGGUGGGGCAUGUCCUCAUCCUUUCCUGCCAUAAAAGCUAUGACACGAGAAUCAGAAUAUUAAUAAAACUUUAUGUACUGCUGUAGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-484.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -517.03
Frequency: 0.0000
Diversity: 352.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((((.(((((((.((((((....((((((((((...)).))....(((((...(((((((.((((........))))......)))))))..)))))))))))......)))))).))).))))..)))...(((((...(((((.....((.((((..(((((.....)))))..)))).))((((...))))....(((((((((.(.((((......))))).)))).......(((.((((((.(((..((....))...)))))))))))))))))((((((.((((...)).)).))))))((((.((((((..(((...)))....)))))).)))))))))....)))))...((((((..(((((....)))))...))))))...))))))...........((((((((((((((..(((.((.((.((..((((((((.((.((((((((((.(((((((((.(.(((.(((((....((((..(((((((....(((((.(((((.....(((((((...(((((((((((((..((((((........((((.((..(((((....((((((....(((((((((((((((......)))))....((((((((.(((((.(((((((((.(.(((((((((((.....((........(((...........))))).....))))))))....(((...(((((((((..(((((.....((((((.....((.((.((((....((....(((((((...(..(((((.((......((((...)))))))))))..)...)))))))..))...)))))).))..)))))).....))))).....))))))))).....)))..))).).))))))).)).))))).))))))))...)))))))))))))))).....)))))..))))))(((((((...)))))))))))))..((((((((...))))))))..((.(..((((((((.......))))))))..).)))))))))...))))))..)))))))....))))).)))))....))...)))))..(((.((...((((......))))....)).)))........(((((.((.(......).)))))))(((((.....))))).(((((........((((.(((((((((..((((............))))..)))).))))).))))((((....))))...........))))))))).)))))))).))))))))))..)))))(((((...((((((........)))))))))))..))))).)).)))))))).))))...)))))..))))))).....(((((......)))))......((((((((((((((.((((((...(((((.....((((((....))))))..((((((...((((((.....))))))..)))).)).(((((...((.((((((((.......)))))))).))..))))).....))))).))))))....))))).)))).))))).......................)))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((((((((,(((((((.((((((..,.(((((((({{...,}.))....(((((...(((((((.,(((........,},)..,)}.)))))))..)))))))))))..,}..)))))).))).)))),,|||...,,||||,,..,,(((({.((.((((..(((((.....)))))..)))).))|||}}...,,.....{{(({{(((.(.((((......))))).)))|,|,.,,{(((.((((((.(((..((....))...))))))))))))}}}))|{|{({.{(((...))},).)))}}|((((.((,,{|,,|||,,,)}}....}|||||,|}},)))},,,}.,,,,,...((((((..(((({....)))))}..))))))...}))))).,,........((((((({((((((..((,,((.((.((..((((((((.((.((((((((((,.((((((((.(.(((.(((({....((((..(((({((....{((((.(((((.....(((((((...(((((((((((({..((((((........((((.((..((((({,..((({(({...(((((((((((((((......)))))....((((((((.(((((.{{(((((((.{..,.((((((((........,,.....(((....,,...,.}}),}.....)))))))).,,.{{{...(((((((((..(((((.....((((((...,.{(,({.((((....{{,...(((((((...,..(((({{((......{{{,...,}}}}))))))..}...))))))).,)),.,})))}),}}..)))))).....))))).....))))))))}.....}}},}})}.).))))))).}}.))))).))))))))...))))))))))}))))}}},..)))))..)}))))(((((((...)))))))))))))..((((((((...}))))))}..{{.{..((((((((.......))))))))..),)))))))))...))))))..)))))))....))))).))))).....}|..}}}}|,,(((.((...{{{{......}})).,..)).)))........{{{{(.{{.({,..,,}.})))))|{{{{{|....))}}},(((|,....,||.((((.{((((((((..((((...,........))))..))))}})))).))))||{{....}))).,,,,}.,...,}}..)))).}))))))),,))))))))}.,})))}(((((...((((((........))))))}))))..))))).)).)))))))).))))...)))))..))))))).,,|.((({{......}}}}}......{(({((((((((((.((((((...(((((.....((((((....)))))).,|{((({...((((((.....))))))..)))).,,.(((((...((.((((((((.......)))))))).))..}))}).....))))).))))))....))))).)))).})))|,,,..,.......,.}}}}.,,,)))))))..
Back