Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_203472.3
Sequence Length
1482 nt
GC Content
0.5000
AGGAGCGCACCGGAAGCGCCCGGCUGGAGGCGCGGCGGCAGGGCUGGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGUCAUGGAACGCCAAGAGGAGUCUCUGUCCGCGCGGCCGGCCCUGGAGACCGAGGGGCUGCGCUUCCUGCACACCACGGUGGGCUCCCUGCUGGCCACCUAUGGCUGGUACAUCGUCUUCAGCUGCAUCCUUCUCUACGUGGUCUUUCAGAAGCUUUCCGCCCGGCUAAGAGCCUUGAGGCAGAGGCAGCUGGACCGAGCUGCGGCUGCUGUGGAACCUGAUGUUGUUGUUAAACGACAAGAAGCUUUAGCAGCUGCUCGACUGAAAAUGCAAGAAGAACUAAAUGCGCAAGUUGAAAAGCAUAAGGAAAAACUGAAACAACUUGAAGAAGAAAAAAGGAGACAGAAGAUUGAAAUGUGGGACAGCAUGCAAGAAGGAAAAAGUUACAAAGGAAAUGCAAAGAAGCCCCAGGAGGAAGACAGUCCUGGGCCUUCCACUUCAUCUGUCCUGAAACGGAAAUCGGACAGAAAGCCUUUGCGGGGAGGAGGUUAUAACCCGUUGUCUGGUGAAGGAGGCGGAGCUUGCUCCUGGAGACCUGGACGCAGAGGCCCGUCAUCUGGCGGAUGAGGCUAAGAAUCUUGUAGAAUAUUCCGUGGUUGCUUCUUGACCAAGGGAAAUACAGUCUGGCUGUGAGAGACUUAAAAUCUCUUGAGGAGCGCUCUGGAGAAUGGCUGAAGGAGAGGAAACAGGAGCCUUGAGCAGUGUAAUUACAAACAAAUAGGUUGGCAUAGUCUUAAGUCUUUGAGUCUAGAGAGAUUUGAGUUUUGUUUUGCCUGUGGAGGCAAUUGGGGGUUUCAGGUCAAAGAGAGGGUCAGUGGAAACAAGGGUGGGCCUUGUGAGGUGUGGGGAAGCCCUGGGACCCUCACUCCCCUUCCAGUGUGUAACUGGAUUGGCUCCCACCAGCCCAGAAGAUUUACGACGUGGGAAAUGGUAUACUUGGAUUAAAAUAUUUCAUCCAGAUUUGUUUACAUCUAGAGAGAACCCCUUGUAGGUUAUAAGGAAACUUUUUAACAUUCUUCCUUGAAUAUAUUUUCUGUAGCUGAAAAUGUUUGUGAAGUGGCUGUCAACUACACAUCGCAUGAGUAGAGGGGCUCUGGGUCGGGGUUUCAUAUGCAGCAGAGCAGCUCCCUUGCUGCCGUCCAUCAAGAGCCCUCAACACAAGAGUUUGUUAUAAAUAGAAAUAAACGACAAAAAGUAGAGGGGUAUGUUUAAGUACACUAUUAGAUGUGACUGACUACCUUGAAACCUGAUUUUUUUCCAUGGGGAGAAACAGUGCUUGAAUUCUGCAUGCCCCCCUUGCAUCUAGCACCUUUUGGUAGGGGUGGAAGGAGGGUGUCAGGGAGAAUGAUUAGGAGAUAAUGGAGGGGAGGGGAAACUUGCGUUGUGUAAUAGCAUUUGAAGAGCACUUACCACGUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-511.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -537.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 350.12
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.(((((..........((.(((((((((((..(((((((((.(((((((((.(((((((.........)))).......))).))).)))).)).)))))))))...........))))))))))).))......))))).))))).(((((((((....)))))))))..((((((((...((..(((((.(((.(..(((.((((((.(((((...(.((((((....(((((......))))))))))).).)))))((((((((((.((...((..(((((((....)))))))))...)).))))))))))((((((.....((((............))))..))))))................))))))..)))....).)))...)))))..))))))).))).(((((((((.(((.(((((.............((((((.........((((.(((((((.........))))))).)))).......(((((((.((........)))))))))...))))))((((.............))))..((((........))))((((((.((((((((((((((.(((.(((((.((((((.(((.((((.(.(((((.........(((.....((((.(((((.......))))).))))..)))))))).))))).))))))......(((((.(((.....))).)))))..((((.................))))((((.((((....(((((((((.((((((.((((.((.(((((((((((........))))))))))))).))))..))))))((((.((((.(((((...........((.(((((((.......((((((.....)))))).......(((....)))...))))))).))))))).(((((.....))))))))).))))...((((.((((((((......((.(((((((((((.((((((((.(((...))).))))))....)).)))...(((((((....(((((((...)))))))...))))))).)))).)))).)).....))))))))..))))....)))))))))....))))))))((((.(((...))).)))).))).))))).))).))))))).....)))..)))))))))))))))))).)))).(((((..(((((.((......(((((((.........)))))))........)).)))))(((.(((..(((.(((........))))))))))))))))).........(((((((....))))))).(((((((....((((.((((((.((((.(((((...(((....)))..))))).)))).))))))))))..(((((.(((..(.((((((.(((..........))).)))))).)..))))))))...)))))))...)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((,(({(,,,,...}}}}}}.((.(((((((((((..(((((((((.((((((((({((,(((,.((.{({..,.))}.}}...))).))).)))),)).)))))))))....||.....))))))))))).))...{{{|||||{||||,.(((((((((....)))))))))....{(((((..,((,.(((((((((.({.(((.((((((..,,(({{{{,((((((....(((((......)))))}})))).,,}}))}((((((((((.((...((..(((((((....)))))))}}...)).))))))))))((((((.....((((.,.....,,...))))..))))))...,,....}}}},..)))))}..})}}}.}),}))...,})))..)))}}))}|,|,{{({.{{((,{{({(((((..................,...,{,...((((.(((((((.........))))))).)))),.,||,.(((((((.((........)))))))))..|(((((((.(({{,{.(({....,))}.}}.|)}.}}}}}))|||,((((({{((((((((((((((.(((.(((((.((({((.(((.((((.(.(((((.....,,,{,{{,..,.((((.{(((({,,,,,,}}}}|,||||..},,|||||.}}}}}.}}))))......|||||,|||,,,,.))).))))}..((((...,,........,...))))|(({,((((....(((((((((.((((((.((((.,{.(((((((((((........))))))))))),,.))))..))))))((((.(((,.(((((,.,,........|.(((((((.......((((((.....))))))......,{{{....)))}..)))))))})})))),{(((((.....))))))))).))))...((((.((((((((.,,...,,.(((((((({{,.,{((((((.{({...,}}.))))))...,)).)}},,.(((((((....(((((((...)))))))...))))))).)))}.)))),,}..,,.))))))))..))))....)))))))))....))))))),{(({.{{|...}}).)))).))).))))).))).))))))).....)))..)))))))))))))}}|}||}|||,{{{{{..(((((.((......(((((((.........)))))))........)).))))){{{.(((..(((.(((........)))))))))))))))},..(((((({.((((((.,,.||||,|,.,,,,||}...,|||{,{(((((.((((.(((((...(((....)))..))))).)))).))))))))})))))}.}})))))|.||,|})}||}),)),,....)))}))),,)})..,.)))))).},)))),},..})}})))}
Back