Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_206809.4
Sequence Length
2042 nt
GC Content
0.4912
AGCACUGCCCUCCAAGAUCUUCCCUUGGGCUUUUCAGCAGUAAGGGGACAUGCACCCCAAGGGCCUCCACUUGGCCUGACCUUGCUGCGGGGGCUCUCUGUCCCCAGGAACAGUAGAGAUGGCAAGCUUAUCAAGACCCUCUCUGCCCAGCUGCCUCUGCUCCUUCCUCCUCCUCCUCCUCCUCCAAGUGUCUUCCAGCUAUGCAGGGCAGUUCAGAGUGAUAGGACCAAGACACCCUAUCCGGGCUCUGGUCGGGGAUGAAGUGGAAUUGCCAUGUCGCAUAUCUCCUGGGAAGAACGCUACAGGCAUGGAGGUGGGGUGGUACCGCCCCCCCUUCUCUAGGGUGGUUCAUCUCUACAGAAAUGGCAAGGACCAAGAUGGAGACCAGGCACCUGAAUAUCGGGGCCGGACAGAGCUGCUGAAAGAUGCUAUUGGUGAGGGAAAGGUGACUCUCAGGAUCCGGAAUGUAAGGUUCUCAGAUGAAGGAGGUUUCACCUGCUUCUUCCGAGAUCAUUCUUACCAAGAGGAGGCAGCAAUGGAAUUGAAAGUAGAAGAUCCUUUCUACUGGGUGAGCCCUGGAGUGCUGGUUCUCCUCGCGGUGCUGCCUGUGCUCCUCCUGCAGAUCACUGUUGGCCUCAUCUUCCUCUGCCUGCAGUACAGACUGAGAGGAAAACUUCGAGCAGAGAUAGAGAAUCUCCACCGGACUUUUGAUCCCCACUUUCUGAGGGUGCCCUGCUGGAAGAUAACCCUGUUUGUAAUUGUGCCGGUUCUUGGACCCUUGGUUGCCUUGAUCAUCUGCUACAACUGGCUACAUCGAAGACUAGCAGGGCAAUUCCUUGAAGAGCUACGAAAUCCCUUCUGAGUGAUGUCACAUCUUGGCAGGGGUGGAGGAGAGCCUGGUUGCCCAGGGAUUUGUCCUUGGGGACAUCUCAUCCAUCAAGUUGCACACUCACUGGCAUCUUUGCUAUGGGGACAUUCCAAUUUGCACUUUCAGGAACACUCUGAAUUCCAAGUAGAAUUGAUUUCCCUUCUUCUGUCAUCUACCUUUUCUCUUCAUUUUCCCAUUUUUAUUACCCUUCUUUCCAUUUCUCUCUCCAGUCUUCCACCUGGAAGCCCUCUCUGGCUAAGGACAGGCAGGUGCCCCUCUCUCCAUCAGAGGACACCUGUACUGGAGAGCAACACAGGAUGGUCUCUGCCAUGAACUGGAGGCCAGGAAUCUCCUCACUGAAAAUUACAGUAUGGUAACUUUGCAAAUGGUGGUUGUUUCUUCCAAGACUCCAGCCCUGAUUGCGCAAAACUGAAAGGCAUGUGAAGGGAAGGAAGAGGAAGAGUGCAAAACAUUGAAGAGAGAGCUGAGUGAGCUGAAGAGUGAGGAUAUGAGUAGCCCCAACCCAAACCUGGAGAUGGGGAGAAACCUACAGAAUACUAGCCAGAGCUCCUCCUUGUCUUGGCAGCCUACUAGGGACCUGGGGAAGCAAAAACGAAAGCUGGGCAACAUGCCUGCUUUAGAAUGUUUUCCUUCUACUUACACAUCUUCCACAGGUCUCAGAAUCUUUCCUUCCUCUCAUCCUUUUCUCCUAUCUUCAUAUCUAUCAGAGUAUCCACUGUUUAUUCAACAACUACUACUUGAUGGUCAGACACAAACAAACAAGCUAGGUGCUAAUUAAUAAAGAUACGAGUUUUGGCCGGGUGCGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGCGGGCGAAUCACGAGGUCAGGAGUUCAAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCCAUCUCUACUAAAAAUACAAACAAUUAACUGAGCAUAGUGGUGGGCACCUAUAAUACCAGCUACUCCGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACCCAGGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGCUGAGAUCGUGCCACUGCACUCUAGCCGGAGUGACAGAGUAAGACUCUGUCUCAAAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAAAAUAAUAAUACAAGUUUUCAUAAGCACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-677.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -714.15
Frequency: 0.0000
Diversity: 541.83
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((..((((.....(((((((((..(((((((((......((((.......))))...(((((((((.((((..((((.(.(((.((((((.....))))))(((((.((((((...((((.(((.....(((.....)))....)))))))))))))..)))))((.(((((....(((...((((((((((((.(((((..((((((((....(.((..(((((.((..(((.....))).)))))))....)).)....)))))))).....))))).))....))))).)))))..)))...))))).))(((((.(((((((...........)))))))))))).....((((((((.(((((..((((((((((...(((.(((((...))))))))((((((((.(.(((((((.(((.(((((((((((........))))))...(((.....((((((.((((.((.((((.((((...)))).)))).)).))))....)))))).....))).(((((.(((((..(((.((((((((....))))))))(((....))).(((((((.(((.(.((....)).)..))).)))))))....((((....)))).((((((.(((.((((((((....(((((.(((.(((((.....(((((((.(((((.....)))))....((((....).)))....((((.((((((((((((((((.(((((....))))).....((((((((((..(((.....(((((.....)))))....))).))))))).))).......)))))))))))..))))))))).))).))))....))))).)))..))).)).....)))))))).))).))).)))..(((.((((((((....)))))))))))...))))))))...)))))...((((.(((((....)))))))))......)))))..)))))))))).)...)))))...)))..(((((..((((............)))))))))......))))))))))................))))).))))))))((((((((((((((....)))))......(((........)))(((((((..(((((.......))))).)))))))))))))))).....))).).))))...)))).)...))))))))((((...)))).((((.......))))..........(((((.(((.(((((..(((....)))...)))))))).))))).....))))))))).....)))))))))..))))...))))).............(((((((.((((.((((..(((((((((...((((..(((((.((((....))).).)))))......(((........))).....)))).)))))).)))..)))).)))).((((((((.(((((........(((((.(((((...))))))))))((((........))))..........))))).))))))))..(((((((.((((((.(((..(..(((((((..(((((..(((.((.(((((....(((.((((.......((((((((..(((.((((.............(((.....))).................(((((((((...(((((((.....)))).))).((((((....)))))))))))))))(((.(..((((.((((((((.(((...)))...)))))))....).))))..))))...........................)))).)))))))))))......))))...))).))))).))))).))))).)))))))..)..)))....)))))).)))))))((((((.((.........))))))))(((((....)))))((((((((...))))))))................................................................))))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,..,(({,.{((((.......})}))||{((((((((((..((((.......))))...({.(((((((((((((..((,,.(((.((((((.....))))))(((((.((((((...(((,,(((...,,(((.....)}),...)))))))))))))..))))).{.((,(({({.(((...((((((((((((.(((((..((((((((....(.((..((((,,((..(({.....))).)))))))....}}.}....)))))))).....))))).}}.},,)))))},))))..)))...))))).))(((((.(((((((...........)))))))}))}}....)))..,.))..))).))))).))))).)).(((.(((((...)))))))).......))))))))))}..||,...(((((((....(((((.((((((((...(({..((((((,((((.((.((((.((((...)))).)))).)).))))....,}}}}},..{{||((((((((.{{{.......((((((({....}))))))){((.,{,||}.{,,,,}},},,,)})))}.,)}))}})))).},}})}))))).)))))))).,...)))))))..(((((((((.,.{,.,,,{,({((((({{...{(((,(,.(((((.....)))))..,,|||,....}.}}}.....((((((((..,,((((,((({((((.....{{(..({{...,,,,,(((({{(((.....,((((({{..|||,,...{{{|..,,))))..,.,{{.{{.||,}|||||,...,))))),,,.})).))).{(((((.((((({(.,,...)}.))))).))))))|(((((({(((((((({((((((((....))))))))....((((.((((((.,{,.,...,,....{((((....))))}(((((..((((..((({.(((((((((...(((((.{........(((((..((((............))))))))).{((((((((((.(((..(((((((....(((((((((((.{(((.((((((((((((((....))))).,.,..(({,,,..,,.|}}(((((((..(((((.......))))).)))))))}))))))))......|||.{(((((({|,,......))))))))}|{,...,||,.((((.......))))..}}....,,{(({(.(((.(((((..(((....)))...)))))))}.))))}|,...||,...,,,..},)))}))))))))).)))))))))..)))...))))))))))}..)))))..)))})))))).})))..))))..)))))..(((....))).)))))))))}..............})))))).)))}})))}}}))..)))))))..})))))}}}.(((((((({......(((((.(((({...}))))))))).,..)))))))))..)}}..}}}.}))))))}))))))))))}}.......})))))))}..,..{((((((.{(({{....(({(({(((((.....((((.....}}}}..,,,}|}}}))))),.,|.............{{{{,,{{|||..........},,..,,||||{((((((((,.(((,{{{{.{((((,...((((({....}))))).,,,.))))}||},,.||,|..((((,{{.||,}..}))}.})))))))},..,{|||...,||||||.{{{,,...................,}}.,,)))})))))))))),,......|||{|,|,,.,).)))))))).))))))}...{{||....}})}))))))))).,((((((.((,,....,,.))))))))|((({....))))}((((((((...)))))))).................................................................,,,,.....,)),..
Back