Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_206825.2
Sequence Length
2030 nt
GC Content
0.4320
AGUUCACACGUGGCGCCAGCGGAGGCAGGUUGAUGUGUUUGUGCUUCCUUCUACAGCCAAUAUGAAAAGGCCUAGUAAGUGGGGUCGGGAGGCGGGCGUGGAGGGACCCACGUCUGGAAGUUGCUGCAGCCACCACGACGCUCUUCUACGGCUACGGCUUUGUCUCUGCUGAGUUAAAGAAAGCAAGUAAACGCAUGACCUGCCAUAAGCGGUAUAAAAUCCAAAAAAAGGUUCGAGAACAUCAUCGAAAAUUAAGAAAGGAGGCUAAAAAGCGGGGUCACAAGAAGCCUAGGAAAGACCCAGGAGUUCCAAACAGUGCUCCCUUUAAGGAGGCUCUUCUUAGGGAAGCUGAGCUAAGGAAACAGAGGCUUGAAGAACUAAAACAGCAGCAGAAACUUGACAGGCAGAAGGAACUAGAAAAGAAAAGAAAACUUGAAACUAAUCCUGAUAUUAAGCCAUCAAAUGUGGAACCUAUGGAAAAGGAGUUUGGGCUUUGCAAAACUGAGAACAAAGCCAAGUCGGGCAAACAGAAUUCAAAGAAGCUGUACUGCCAAGAACUUAAAAAGGUGAUUGAAGCCUCCGAUGUUGUCCUAGAGGUGUUGGAUGCCAGAGAUCCUCUUGGUUGCAGAUGUCCUCAGGUAGAAGAGGCCAUUGUCCAGAGUGGACAGAAAAAGCUGGUACUUAUAUUAAAUAAAUCAGAUCUGGUACCAAAGGAGAAUUUGGAGAGCUGGCUAAAUUAUUUGAAGAAAGAAUUGCCAACAGUGGUGUUCAGAGCCUCAACAAAACCAAAGGAUAAAGGGAAGAUAACCAAGCGUGUGAAGGCAAAGAAGAAUGCUGCUCCAUUCAGAAGUGAAGUCUGCUUUGGGAAAGAGGGCCUUUGGAAACUUCUUGGAGGUUUUCAGGAAACUUGCAGCAAAGCCAUUCGGGUUGGAGUAAUUGGUUUCCCAAAUGUGGGGAAAAGCAGCAUUAUCAAUAGCUUAAAACAAGAACAGAUGUGUAAUGUUGGUGUAUCCAUGGGGCUUACAAGGAGCAUGCAAGUUGUCCCCUUGGACAAACAGAUCACAAUCAUAGAUAGUCCGAGCUUCAUCGUAUCUCCACUUAAUUCCUCCUCUGCGCUUGCUCUGCGAAGUCCAGCAAGUAUUGAAGUAGUAAAACCGAUGGAGGCUGCCAGUGCCAUCCUUUCCCAGGCUGAUGCUCGACAGGUAGUACUGAAAUAUACUGUCCCAGGCUACAGGAAUUCUCUGGAAUUUUUUACUGUGCUUGCUCAGAGAAGAGGUAUGCACCAAAAAGGUGGAAUCCCAAAUGUUGAAGGUGCUGCCAAACUGCUGUGGUCUGAGUGGACAGGUGCCUCAUUAGCUUACUAUUGCCAUCCCCCUACAUCUUGGACUCCUCCUCCAUAUUUUAAUGAGAGUAUUGUGGUAGACAUGAAAAGCGGCUUCAAUCUGGAAGAACUGGAAAAGAACAAUGCACAGAGCAUAAGAGCCAUCAAGGGCCCUCAUUUGGCCAAUAGCAUCCUUUUCCAGUCUUCCGGUCUGACAAAUGGAAUAAUAGAAGAAAAGGACAUACAUGAAGAAUUGCCAAAACGGAAAGAAAGGAAGCAGGAGGAGAGGGAGGAUGACAAAGACAGUGACCAGGAAACUGUUGAUGAAGAAGUUGAUGAAAACAGCUCAGGCAUGUUUGCUGCAGAAGAGACAGGGGAGGCACUGUCUGAGGAGACUACAGCAGGUGAACAGUCUACAAGGUCUUUUAUCUUGGAUAAAAUCAUUGAAGAGGAUGAUGCUUAUGACUUCAGUACAGAUUAUGUGUAACAGAACAAUGGCUUUUUAUGAUUUUUUUUUUAACAUUUUAAGCAGACUGCUAAACUGUUCUCUGUAUAAGUUAUGGUAUGCAUGAGCUGUGUAAAUUUUGUGAAUAUGUAUUAUAUUAAAACCAGGCAACUUGGAAUCCCUAAAUUCUGUAAAAAGACAAUUCAUCUCAUUGUGAGUGGAAGUAGUUAUCUGGAAUAAAAAAAGAAGAUACCUAUUGAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-563.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -606.14
Frequency: 0.0000
Diversity: 397.69
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((.((((.(((.((...((((((((.((((((((((((((.(((((.((((......((.((((((((((..(((((((((((.(((((((((((......))))))))....((....)).))).)).)))).....))))).)))).)))))).))...))))))...))).)))))..)))))))))))))))))....)))))......(((.........(((((........)))))..........))).(((....)))(((((..((((..((((.((......(((((((((((...((((..(((((..((((((...))))))))))).))))((((..(((..(((((((((.(...........(((((((....(((.(((.((...((((..(((..(((.........)))....))).)))).........((((.....))))..(((.(((.......(((.((((((((((..((((....(((.((((((((.((((.((((..(((...))).))))..))))..).)))).....)))..))).(((((((((.(((.(((((((((..((((...))))....)))))((((..((((((.((((........)))).)..((((((...)))))).......(((((..((((.....))))))))))))))..)))).)))).))))))))).)))(((..((((.(((....))).)))))))..))))..))..)))))))).)))....))).))).....((........))..)).))).)))...........)))))))...........).))))))....((((((((..(((.((((((((((((...))))))))))))..(((.(((((....((((.(((...((((.(((((((((((((....)))))))...(((((((((((....(((.....)))......)).))))))))).((((.((....))..)))).((((.((((....((....(((((((......................)))))))...))..))))))))..)))))).)))).(((((((((((((....))...)))))))......)))).....)))))))..))))).))))))...))))))))(((....)))...(((......))).......))))))..))))...))))))).)))).......(((((((((((..(((((((.(((((.(((((...((..(((....)))....))...)))))))))...((((((((((((...(((((((.((((((((((((((.((.....(((((((((..........(((((((((((((((((....))))))).((.((...........)).)).(((..((((((((.(((((((((....((((.....))))..((....))...((((.......)))).........)))))))))))))))))..)))......................((.((............))))..............)))....))))))))))).))))).((..((((((.........))))))..)).))))))))))..(((((((....)).))))).((((......).)))..)))))))))))))...)))))))))))).....((((((.((((((.....)))))).((((.((((((......))))))..))))...(((.(((((.......))).)).))).....((((...(((.((........)))))...))))))))))......).)))))))..)))).)))))))(((((.....))))).........((((((...))))))....))))))..))))..))))).....(((......))).........))))))))))....(((((.(((((..............))))).)))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{(({{,.,{{,.(((.((..,((((((((.((((((((((((((.(((((.((((......((.((((((((((.,(,(({((((((.(((((((((((......))))))))....,,....,}.))).)).)))).)},.,}},,.)))).)))))).))...))))))...))).)))))..))))))))))))))))).}..)))))......(((......,..(((((........)))))..,,......))).(((....)))(((((..((((..((((.((,{{,,.(((((((((((...((((..(((({..((((((...))))))))))).))))((((..{,...|,,{{{{{{.,...........(((((((....(((.(((.((...((((..(((..{{{.........)))....))).)))).........((((.....))))..(((.(((.......(((.((((((((((..((((....{{{.((((((({.((((.((((..(((...))).))))..))))..}.|))).....)))..))).(((((((((.(((.((((.((((,.((((..,||||{,..})))|{|||..{{{{{{.{(({........)))),).|((((({...}))))),......{((((,,({{{.....}}},}}}})})))),})))).)))).))))))))).)))(((..{(({.(((....))).}))})))..))))..)),.)))))))).)))....))).))).....((........))..)).))).)))...........)))))))...,,,,....),))|||,(({{((((((((,.(((.{(((((((((((...))))))))))))..(((.(((((....((({{(((..,((((.(((((((((((({....})))))}.,.((((((((({,.,..{({.....,,,......}},))))))))).|{{,{((,.{{||..}||,.{{{{.{{{{..,|{{|||,|,|||||..,}.{{{....}}}...|{{,}},|||}...,,}})))))))),.}))))).)))).({{{(((((((.{{{...},..)))))))......}}}}.....)))))))..))))).)))))).,.))))))))))).},,|||.{{(((,,,,,.,,,...,...))))),..)))}...))))))).))))..,}}},(((((((((((..(((((((.(((((.(((((...{{.,(((....)))..,.))...)))))))))...((((((((((((...(((((({{((((((,{{,((((.{{.{{{,(((((((((..........(((((((({((((((({....,)))}}|{(({.....}}},.......{({((,..(((((((,,(((((((((....((((.....||}}..{,{{,......|||{.......))))....)),}.))))))))))))))))){{|,.....,|................,,.|,..,.........}}||.....}}.......,))}}})))))))))))).))))).((..((((((.........))))))..))..|}|||||,}...,{||||,..,||,,}},),||||,,.,,,).}}}..)))))))))))))...)))))))))))).,...((((((.((((((.....)))))).{,{{,((((((,,,,,.}}||}},,}|||,.,|||.|{{{{,,,,.}|}}},.|,..,...,,{|{{..,|||,||,.......}})))...)))})))))).....}).)))))))..))))},))))))(((((,....})}}}......,,.{{{{{|...}))}}}....))))))..))))..))))).....{((......)))...,{{{.,{||.,}))))}}},{((((.(((((..............))))).))))),,....
Back