Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_206898.2
Sequence Length
627 nt
GC Content
0.5056
GGAUAAUGGGGAGGCUAUGCAGGUGUGUGGGCUGGAGGGACUUUGCAGAUGUGAUUAAGGAUUGUGAGAUGGAAAAAUUAUCCUUGAUUACCUGCACGGACCCAGUAUAAUCACAACUGUCCUUAUAAGAAGAGGAGCUUUGGAAGAAGAGAGAGUUGACUACGGAAGAGGGAAAAGUGCCACAGACAUGGCCAACGGGACCAACGCCUCUGCCCCAUACUACAGCUAUGAAUACUACCUGGACUAUCUGGACCUCAUUCCCGUGGACGAGAAGAAGCUGAAAGCCCACAAACAUUCCAUCGUGAUCGCAUUCUGGGUGAGCCUGGCUGCCUUCGUGGUGCUGCUCUUCCUCAUCUUGCUCUACAUGUCCUGGUCCGCCUCCCCGCAGAUGAGCUUUAACACAGAUGAAUCUCUUCUGCAUUCAGAAGUGCUGCCUCAAACUCGAGCUAUUUCCUGUGAUGAGCUCCAAGCCCCUAGAGAGGAAGGGGCGGCCUGACGAGGCACUGGAUGGGCCUCAUGGCCUAGAAGUCCCCACAUUCCUUGCAACUCUGAUGCUGGGCACCUACAGGCCCGAGUUUAUCAUUUACUGGGCAGUUCAAUAAAGUCCUCUCAACUUUUCUUGUCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-198.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -209.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 147.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...((((((((....(((((((((((((.((((((.((.(((((..((((((((((((.((...........)).))))))))))))))))).)).)))..........(((((.(((((....((((.....)))).....))).)).))))).....(((((((.(....(((((((.((...(((...((((........(((.((((.......(((((...........(((((...)))))..(((..(((...))).)))....)))))...((.(((............)))...)).....)))))))))))...))).)))))))))).)))))))...))).)).))))))).))))....))))))))(((((.(((.((((.......)))).))).)))))........(.(((((((...................(((((((((((...((((((........))))))((((((...(((.(((...((((((....))))))..))).((((((((............)))).))))..))).)))))).))))))))))).....))))))).)......))))....................
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((({,.((((((((....(((((((((((((.((((((.((.(((((..((((((((((((.{{...........)).))))))))))))))))).)).))).,........(((((.(((((....((((.....)))).....))).)).))))).{{{{((((((({.....({((((,.,...}|||,..,(((.......,,...}}}}|,,,...,,|.|}}}........({{({...}}})).}}}}.})}}})))),,{|{{{{,{{{,,..{{{,{{{......,,....}}||..,||..|}))))|,||,})}|}}}|.}}))))})))})))))))}}.))).)).))))))).))))....))))))))(((((.(((.((((.......)))).))).)))))........{.(((((({,{,,,,,{{{{,,,|,,..{{||{{{||||...((((((........))))))((((((..,,((.(((...((((((....))))))..))),}|,.....{{,.(({.....,.))).)))...,..)))))).))))))}}}},.....))))))).)....,,||,,.....}},,,..,})}}...
Back