Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_207005.3
Sequence Length
1776 nt
GC Content
0.5434
GCCCCUCACCAACAUGGCCGCGGGCUGGAAGUGCGCAUGAGCAGCUGUCUAUGGAGAUACCUAGGCCGGGAGAGGGAGAACACAGUUGGAGAAAAUCGGCAGCUGAGACGGCCUUGGCCGGACUUAGCACUCAGGCCUGUGAAUCAGGAGAUACAAAGACCUCCAAAAAAGGACCAGUUCCUCGGAUGUGCCCCCUCACAGAGAGAUGAAGGGGCAGCAGAAAACAGCUGAAACGGAAGAGGGGACAGUGCAGAUUCAGGAAGGUGCAGUGGCUACUGGGGAAGACCCAACCAGUGUGGCUAUUGCCAGCAUCCAGUCAGCUGCCACCUUCCCUGACCCCAACGUCAAGUGAUGUACAGGGUGAUCCAGGUGUCUGAGGGGCAGCUGGAUGGCCAAACUGAGGGAACUGGCGCCAUCAGUGGCUACCCUGCCACUCAAUCCAUGACCCAGGCGGUGAUCCAGGGUGCUUUCACCAGUGAUGAUGCAGUUGACACGGAGGGGACAGCUGCUGAGACGCACUAUACUUACUUCCCCAGCACGGCAGUGGGAGAUGGGGCAGGGGGUACCACAUCGGGGAGUACAGCUGCUGUUGUUACUACCCAGGGCUCAGAGGCACUGCUGGGGCAGGCGACCCCUCCUGGCACUGGUCAAUUCUUUGUGAUGAUGUCACCACAAGAAGUACUGCAGGGAGGAAGCCAGCGCUCAAUUGCCCCUAGGACUCACCCUUAUUCCCCGAAGUCAGAAGCUCCCCGGACGACUCGGGAUGAGAAACGCAGGGCUCAGCAUAAUGAAGUGGAGCGUCGCCGCCGAGACAAGAUCAACAACUGGAUCGUGCAGCUCUCCAAGAUAAUCCCAGACUGCUCUAUGGAGAGCACCAAGUCUGGCCAGAGUAAAGGUGGGAUUCUAUCCAAAGCUUGUGAUUAUAUCCAGGAGCUUCGGCAGAGUAACCACCGCUUGUCUGAAGAACUGCAGGGACUUGACCAACUGCAGCUGGACAAUGACGUGCUUCGACAACAGGUGGAAGAUCUUAAAAACAAGAAUCUGCUGCUUCGAGCUCAGUUGCGGCACCACGGAUUAGAGGUCGUCAUCAAGAAUGACAGCAACUAACUAUGGGGAUUCAGGGGCUUUGGGCCCAAGAACUGCAGAUAGCCCAGGAGCAACAGCCUAAUCCCGUGCCCCUUUCCUUCACUGCCCCACUUCUGGCAUGGGACAGGGGGAAGUUCAGAAGGUGUGUCCUUGAACUGAGGCCCUGUGAUAUGGCGGCCUGCAGUGGUGUGAAACACACAAUGUGGACGUGCACUGACAGCCUUGCCCACCCCCACCAUGCAGCCCCUGGGCCCUUGUGCUCCUCUCGCACAAUGCAUGUGCUGUCUCCAUGCUGGAUACUGGACACACUAAACUCUGGGGCUUGUCCUGUGCUUGCUUAGAGUGCCCAGCAGAGGUUUGCUGACAGGUGAUGCUCUGGCUUGCCCCAGGACUCUGGCACUUCCAUUGGUUCUUCCUUUCCCUGGAGCUGAGGUUUAGAUGUGCAACCUGUGGCUCAGGGGAGCAAGCUUACACAAGAAGUGAGGGAAGGAUGUUUAGCAGUGGCUGGUGCCCAUGAAGAGGAGAUUGGCCAGUGAGAAGCUGAGGCCUAUGCAGACAUCUCUGGAGCCAGAGAGAACAACAGGCAGGGGCCCACUUGGGGCCUUCCCCCUUGUGGGGGUCGUUUUUUUUUUUUCUUUUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUAAGAUAAAAUUGUUCAAAGCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-665.77 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -700.06
Frequency: 0.0000
Diversity: 398.19
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..............((((.((((((((..(((((((.(.(((((((((((...(((....(((((((((..((((..(....((((((..((...))..))))))...)..))))..)))).)))))..)))...((((.....))))...........(((((.......(.((((((((((((....(((((.(((........))).)))))(((........)))...........((((.(((..........((((((((((((((((..((((.....))))....(((((((....)))).)))..))))).))).))))))))))).)))).(((((....)))))....(((.((((((.(((((...))))).)))))).)))...)))).)))))))))(((((((.(((.(((((((.((((....((........)).))))...)))))))......))).)))))..)).........)))))))))))))))).)((((((((......((((((((.....((((((((((((.((((((.(((((........(((.((((((((....)))).)))).))).(((((..(((...(((..((((((((((...((((((.(((...((...(((((.(((.((....)).))))))))..))))).)))))).......))))....)))))))))..))).((((...((((((.(((.((..(((.(((((.....))))).........((.(.((((.((........)).)))).).)).((((............(((((((.(((.(((((..((((........((((((((((((....)))))....))))))).((((.....(((((.(((((..((.((((((.((........)).)))))).)).)))))..))))).....)))).....((((((((......))..)))))).))))..........((((.((.....)).)))).((((......))))....)))))..)))..)))))))))))(((.(......).))).(((((.....))))))))..)).))).))))))...))))(((((((((................))))).))))...))))).))))).)))))))))))..)))))))......(((........)))))))))))......)))))))).....(((((((((((((...)))).))))).)))).(((((...))))).........)))))))..))))).)))..((((((((......((((((((((((((((....((((((((((.....)))))((((((((...)))).....))))......((((((((.(..((.....))..)))))))))((((((.(((.((((((....((((...(((((.(((.(((......((((((((((.((((((((((((((.((((((.(((((.(((((((....)).)))))..))))).))))))....(((((.......)))))))))))))......))))))..)))))).....))))......))).))).)).)))....))))..)))))).))))))).))..)))))........)))))))))))...)))))..........))))))))........((((.((((...............................)))).)))).........))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..............{(((.((((((((..(((((((.,.(((((((((((...(((....(((((((((..((((..,....((((((..(,...})..)))))).,.|..))))..)))).)))))..)))...((((.....))))...........(((((......,{.((((((((((((...{(((((.(((......,.))).)))))|{(,.......,)},..........((((.{{(........,.((((((((((((((((,,((((.....)))}....{((((((....)))).)}}..))))},)))}})))))))))).)))).(((((....)))))....(((.((((((.(((((...))))).)))))).)))...))))))))))))),,|{{{,({((({.,,,,,|}||||....{{.,,...,.}},}||}.,,}}}||||....},)),.})))},,}}..,...,,,)))))))))))))))).}((((((((.,.,,.((((((((.....((((((((((((.((((((.(((((........{((.((((((((....))))}}))}.))).(((((,.,.{((,{{,({(((((,(((....((((((.(({..{((...((((({(((.((....)).))))))))..))))).))))))..))).})||{{{{.,|||||{,{{,.,,.{{{{.,.((((((.{((,,(..(({.(((({.....)))))..,.,...,((.{.((((,{(........)).}})),}.||.(((((..(,.{........}}},.))}.}}.||{{{{{{{{{.....{{{{{{{{{|||.,,,))))).....)))))),((((.....(((((.(((((..((.((((((.((........)).)))))).)).)))))..)))))..,..)))).....{((((({{......}}..))))))}}}},}..,|.||,|||||}|}....}||||,|((((((......)))},))}{||||..|,,...,.),,))))),|||,,{.{{{|.,||.(((((.....))))),))..))}))).)))))),}}))))}),})))))))..,...,}}.,...)))},||}}}....}))}.))))).)))))))))))..)))))))......(((........)))))))))))..,,..)))))))).....(((((((((((((...}))).))))).)))).(((((...))))).........)))))))..)))))},)),.((((((((...,..((((((((((((((((.(((((((,(((((.....))))){((,((((...,}}}.,,,|)}}}},......{(({{(((..((({,{.((,.{{{,{{{{{(((((((({....})))))..,)))...))})})))..))}})))).,,,.((((((.(((((((((((((({((((((.(((((,((((({{....}}.))))).,)))))}))))),....(((((.......)))))))))))))......))))))..))))))...},)))))))...(((((((.....)))..))))..,,..,...((((((....)))))).........)))))))))))...)))))..........)))))))).,................................,,,,,,,,......)))).)))}.........)))}
Back