Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_207163.3
Sequence Length
2287 nt
GC Content
0.4451
AGUUGUUGACCAGCCUGCCACUUGCCUCCCUGCCUGCUUCUGGCCGCCUUGAAUGCCUGGUCCUUCAAGCUCCUUCUGGGUCUGACAAAGCAGGGACCAUGUCUACCUUUGGCUACCGAAGAGGACUCAGUAAAUACGAAUCCAUCGACGAGGAUGAACUCCUCGCCUCCCUGUCAGCCGAGGAGCUGAAGGAGCUAGAGAGAGAGUUGGAAGACAUUGAACCUGACCGCAACCUUCCCGUGGGGCUAAGGCAAAAGAGCCUGACAGAGAAAACCCCCACAGGGACAUUCAGCAGAGAGGCACUGAUGGCCUAUUGGGAAAAGGAGUCCCAAAAACUCUUGGAGAAGGAGAGGCUGGGGGAAUGUGGAAAGGUUGCAGAAGACAAAGAGGAAAGUGAAGAAGAGCUUAUCUUUACUGAAAGUAACAGUGAGGUUUCUGAGGAAGUGUAUACAGAGGAGGAGGAGGAGGAGUCCCAGGAGGAAGAGGAGGAAGAAGACAGUGACGAAGAGGAAAGAACAAUUGAAACUGCAAAAGGGAUUAAUGGAACUGUAAAUUAUGAUAGUGUCAAUUCUGACAACUCUAAGCCAAAGAUAUUUAAAAGUCAAAUAGAGAACAUAAAUUUGACCAAUGGCAGCAAUGGGAGGAACACAGAGUCCCCAGCUGCCAUUCACCCUUGUGGAAAUCCUACAGUGAUUGAGGACGCUUUGGACAAGAUUAAAAGCAAUGACCCUGACACCACAGAAGUCAAUUUGAACAACAUUGAGAACAUCACAACACAGACCCUUACCCGCUUUGCUGAAGCCCUCAAGGACAACACUGUGGUGAAGACGUUCAGUCUGGCCAACACGCAUGCCGACGACAGUGCAGCCAUGGCCAUUGCAGAGAUGCUCAAAGUCAAUGAGCACAUCACCAACGUAAACGUCGAGUCCAACUUCAUAACGGGAAAGGGGAUCCUGGCCAUCAUGAGAGCUCUCCAGCACAACACGGUGCUCACGGAGCUGCGUUUCCAUAACCAGAGGCACAUCAUGGGCAGCCAGGUGGAAAUGGAGAUUGUCAAGCUGCUGAAGGAGAACACGACGCUGCUGAGGCUGGGAUACCAUUUUGAACUCCCAGGACCAAGAAUGAGCAUGACGAGCAUUUUGACAAGAAAUAUGGAUAAACAGAGGCAAAAACGUUUGCAGGAGCAAAAACAGCAGGAGGGAUACGAUGGAGGACCCAAUCUUAGGACCAAAGUCUGGCAAAGAGGAACACCUAGCUCUUCACCUUAUGUAUCUCCCAGGCACUCACCCUGGUCAUCCCCAAAACUCCCCAAAAAAGUCCAGACUGUGAGGAGCCGUCCUCUGUCUCCUGUGGCCACACCUCCUCCUCCUCCCCCUCCUCCUCCUCCUCCCCCUCCUUCUUCCCAAAGGCUGCCACCACCUCCUCCUCCUCCCCCUCCUCCACUCCCAGAGAAAAAGCUCAUUACCAGAAACAUUGCAGAAGUCAUCAAACAACAGGAGAGUGCCCAACGGGCAUUACAAAAUGGACAAAAAAAGAAAAAAGGGAAAAAGGUCAAGAAACAGCCAAACAGUAUUCUAAAGGAAAUAAAAAAUUCUCUGAGGUCAGUGCAAGAGAAGAAAAUGGAAGACAGUUCCCGACCUUCUACCCCACAGAGAUCAGCUCAUGAGAAUCUCAUGGAAGCAAUUCGGGGAAGCAGCAUAAAACAGCUAAAGCGGGUGGAAGUUCCAGAAGCCCUGCGAUAAAAACAUGAUCUUUAGAAGAGGAUGCAGAACUGUUCAGUGGUAUUACAUGAAAUGCAUUGUGAGAUGUUUCUAAAAUACCUUCUUCAAUUCAAAAUGAUCCCUGACUUUAAAAAUAAUCUCACCCAUUAAUUCCAAAGAGAAUCUUAAGAAACAAUCAGCAUGUUUCUUCUGUAAAUAUGAAAAUAAAUUUCUUUUUUAUGUCGUGAGAUUUGUAUUGGCAAGAAGCAGUUAAUUUAAAGAUGCUCUUCCUAUCUGUGGAUGUGUUGGUAACUCCGAGUUGUAAUGAGUUCAUGAAAUGUGCUGUUAUUUUUGUAAUCUCAAUAAAUGUGGAUUGAAGUUUUUUCCCUUUUUUUAAAGCCAAACUAAUAUUUUUCUGUGACUUGAUACAUCUGUCAGAUUUUUGUAAUCUCGAUAAAUGUGUAUUGAAGUUUUUUCCCUUUUUUUAAAAAGCCAAACUAAUAUUUUUCUGUGAGUUAAUACAUCUGUCAGGUGUGUAUGUAACAUUACUGGACAUUAAAAAAAAAUAUUACAUUCUCACCCAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-648.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -692.36
Frequency: 0.0000
Diversity: 527.80
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((...((((((.((((...((.(((.((((.((((((((((((((...((((((((((((((.(((((((...((.((((((.....((((....((((..((((((...)))))).))))..........(((.....))).((((((.....))))))..)))))))))))))))))))))))))).))))...(((.((((....................)))))))(((((((((...((((......))))............)))))).))).......)))..)))))......))))..((((((.......))))))...(((...))).))))))))).)))))...))))..)))))).....))))).((((((((.((((((((((((..((((((((.......))))))))((((((.(((.(((......(((((((.((((((((((....((((((..((((((((.((.((..(.((.((.(((((.......(((((..((......))..)))))...(((((........)))))((((....))))...(((.......))).........(((((((...........))))))).(((((((((...((((...........))))..)))))))))......(((((.....((((((.(((.(((((((((((((((..(((.....(((((........((((((((...(((((.(.....).)))))..................((((....(((((...)))))....))))......)))))))).((((.....))))(((((....((.((((.......).)))))..)))))))))).((..((((((.......))))))..))............)))..))))))((((((...((((..(((((...((((((...((((.((((((((((((......)))))...))))((.(((((((((..(((((......)).)))........))))))))).)).((((((((.((((...........((.((.((((.(((((((((.............))))))..)).....).)))))).)))))).))))))))......((......))...(((((....)))))....((.......)).((.((((((((((((.....)).)))...((((....))))((..(((((..........)))))..))....))))))))).))).))))...))))))))))).....))))......(((....))))))))))).))))))).)))..)))))))))))..))))).)).)).)..)).)).))))))))..)))))).........(((.((....))))).)))))))))).)))))))))))))))))))..))))))(((((.(((((..(.(((((.((.(((((...((((((((((((((...))))))...................((((((((((((((((.((((...(((....((((((((......((((........))))((((..((.(((....(((((.....((((.....))))....)))))....))).))..)))).(((((((...(((((....(((((((((((.(.(((((((..((((((((((...(((.....(((((.....))).))......)))...)))))).((.((((.(((((.((......((((((....(((..(((((....))))))))...)))))).....)).)))....))))))))............((((((((......((((......))))...((((((((.......))))))))......(((((((((.........))))))))).))))))))......((.((((.(((.............)))))))))...))))...))))))).)..))))))))))).))))))))))))...))))))))....(((......)))....)))...))))..))))))))))))))))................))))))))...))))))).))))).)..)))))))))).((((((......))))))...)))))).))))))))............((((((((((((((((((((((((((((...))))))))...)))).)))).))).........)))))))))................
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,,,,..((((((({((((.({((((,({((,({((((((((,,{(((...{{,((((((((((,,(((((((...((.(((({,...,(((((....{{{{..((((((...)))))).|||},,.,,.....|||.,,,.,,|.((((((.....))))))..)))))))))))))))))))))))))).))))...|{|.|||||,}|.........,,.....},,,,,((((((((((...((((......))))............)))))).))))....,,)))}.)))))}..,.}))),..((((((.......))))))...(((({.....)))))))))}))|||{{{||||..,|||||..,{{||,|{,(,((((((.{{,{{,((((((..((((((((.......))))))))((((((.((,{(((......(((((((,((((((((((....((((((..((((((((.((.((..(.((.((.(((((........{((,..,,....,{||{.}},,|,,.{((((........))))|((((....))))...{,,.......,},.........(((((((..,.....,..))))))).(((((((((..{(((,,,.........)))))})))))))))..}}}}|((((.....((((((.(((.(((((((((((((((..{{,.....((({(,.,..,,.((((((((..|{{{.,.{,.......,|||.....||,.......,..((((....(((((...)))))....))))......)))))))).((((.....))))(((((....((.(((,.,,....),)))))..)))))}}}}}.((..((((((.......))))))..))..,.,,{....,))}..)))))}((({{{,..((((..(((((,..((((((...((((,((((({{(((((......)))))...))))||,(((((((({..(({..{{{.,.,,.,||...})).,)))),,}))})).{(((((((.((((...,.......{,.{{,((((.{{{((((((...{,...,}...))))))..}}.....}.)))),}.)))))).)))))))}......|{......}}...{{,,.....|||||....|},,.....||.((.(((((((({{{(,,,..|},.,}...{{{(....)))){{..(((((..........)))))..)),,.,))))))))).})).))))...))))))))))).....))))......,||.,..,,)))))))))}})))))).)))..)))))))))),..))))).)).)).}..)).)).))))))))..)))))).........,((.,,....},,)),)))))))))).)))))))))))))))))))..)))))){(((,{(((((..(.(((((.((.(((((...((((((((((((((...)))))},......,{,.........((((((((((((((((.((((,,,((({{,,.,{{{,,{,{,...||||........}|||((((,.((.(((....(((((.....((((.....))))....)))))....))).)),.))}}.(((((((...(((((....(((((((((((.{.(((((((..((((.{{..(((((((((...)))).....))}))..,.....,,,,{{{{{{.(({({({{{,{{{{{,,,{{{{,,((((((....{{|,,||{{{.,,,}|})}}}),..}})}}).,}}||,..,,....})),,..,,..,}},...,,{(((((((......,,{{..,,,,}}}}|,,{(((((((.......))))))))..,...({(((((({......,,.))))))))).)))))))),,}...((.(((,{(((.,,..........))))))))),,.))))...))))))).}..))))))))))).})))))))))))..}),)))))}.,}}}||,,,,{{{{,....}},,,}))),,.))))))))))))))))....,,.........,})))))))...))))))).))))).)..)))))))))}.((((((......)))))).,.}})))),)))))))}....}}},....,,{{{{{{{{{|(((((({{((((((((...}))}))))...}})).)))).))).........,}}}}})))}}))))).........
Back