Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_207520.2
Sequence Length
2297 nt
GC Content
0.4928
AUUGUUCCGGGAGCCGUCACCACAGUAGGUCCCUCGGCUCAGUCGGCCCAGCCCCUCUCAGUCCUCCCCAACCCCCACAACCGCCCGCGGCUCUGAGACGCGGCCCCGGCGGCGGCGGCAGCAGCUGCAGCAUCAUCUCCACCCUCCAGCCAUGGAAGACCUGGACCAGUCUCCUCUGGUCUCGUCCUCGGACAGCCCACCCCGGCCGCAGCCCGCGUUCAAGUACCAGUUCGUGAGGGAGCCCGAGGACGAGGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAAGAGGAGGACGAGGACGAAGACCUGGAGGAGCUGGAGGUGCUGGAGAGGAAGCCCGCCGCCGGGCUGUCCGCGGCCCCAGUGCCCACCGCCCCUGCCGCCGGCGCGCCCCUGAUGGACUUCGGAAAUGACUUCGUGCCGCCGGCGCCCCGGGGACCCCUGCCGGCCGCUCCCCCCGUCGCCCCGGAGCGGCAGCCGUCUUGGGACCCGAGCCCGGUGUCGUCGACCGUGCCCGCGCCAUCCCCGCUGUCUGCUGCCGCAGUCUCGCCCUCCAAGCUCCCUGAGGACGACGAGCCUCCGGCCCGGCCUCCCCCUCCUCCCCCGGCCAGCGUGAGCCCCCAGGCAGAGCCCGUGUGGACCCCGCCAGCCCCGGCUCCCGCCGCGCCCCCCUCCACCCCGGCCGCGCCCAAGCGCAGGGGCUCCUCGGGCUCAGUGGAUGAGACCCUUUUUGCUCUUCCUGCUGCAUCUGAGCCUGUGAUACGCUCCUCUGCAGUUGUUGACCUCCUGUACUGGAGAGACAUUAAGAAGACUGGAGUGGUGUUUGGUGCCAGCCUAUUCCUGCUGCUUUCAUUGACAGUAUUCAGCAUUGUGAGCGUAACAGCCUACAUUGCCUUGGCCCUGCUCUCUGUGACCAUCAGCUUUAGGAUAUACAAGGGUGUGAUCCAAGCUAUCCAGAAAUCAGAUGAAGGCCACCCAUUCAGGGCAUAUCUGGAAUCUGAAGUUGCUAUAUCUGAGGAGUUGGUUCAGAAGUACAGUAAUUCUGCUCUUGGUCAUGUGAACUGCACGAUAAAGGAACUCAGGCGCCUCUUCUUAGUUGAUGAUUUAGUUGAUUCUCUGAAGUUUGCAGUGUUGAUGUGGGUAUUUACCUAUGUUGGUGCCUUGUUUAAUGGUCUGACACUACUGAUUUUGGCUCUCAUUUCACUCUUCAGUGUUCCUGUUAUUUAUGAACGGCAUCAGGCACAGAUAGAUCAUUAUCUAGGACUUGCAAAUAAGAAUGUUAAAGAUGCUAUGGCUAAAAUCCAAGCAAAAAUCCCUGGAUUGAAGCGCAAAGCUGAAUGAAAACGCCCAAAAUAAUUAGUAGGAGUUCAUCUUUAAAGGGGAUAUUCAUUUGAUUAUACGGGGGAGGGUCAGGGAAGAACGAACCUUGACGUUGCAGUGCAGUUUCACAGAUCGUUGUUAGAUCUUUAUUUUUAGCCAUGCACUGUUGUGAGGAAAAAUUACCUGUCUUGACUGCCAUGUGUUCAUCAUCUUAAGUAUUGUAAGCUGCUAUGUAUGGAUUUAAACCGUAAUCAUAUCUUUUUCCUAUCUAUCUGAGGCACUGGUGGAAUAAAAAACCUGUAUAUUUUACUUUGUUGCAGAUAGUCUUGCCGCAUCUUGGCAAGUUGCAGAGAUGGUGGAGCUAGAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCUUUUCAGUUUGUGCACUGUGUAUGGUCCGUGUAGAUUGAUGCAGAUUUUCUGAAAUGAAAUGUUUGUUUAGACGAGAUCAUACCGGUAAAGCAGGAAUGACAAAGCUUGCUUUUCUGGUAUGUUCUAGGUGUAUUGUGACUUUUACUGUUAUAUUAAUUGCCAAUAUAAGUAAAUAUAGAUUAUAUAUGUAUAGUGUUUCACAAAGCUUAGACCUUUACCUUCCAGCCACCCCACAGUGCUUGAUAUUUCAGAGUCAGUCAUUGGUUAUACAUGUGUAGUUCCAAAGCACAUAAGCUAGAAGAAGAAAUAUUUCUAGGAGCACUACCAUCUGUUUUCAACAUGAAAUGCCACACACAUAGAACUCCAACAUCAAUUUCAUUGCACAGACUGACUGUAGUUAAUUUUGUCACAGAAUCUAUGGACUGAAUCUAAUGCUUCCAAAAAUGUUGUUUGUUUGCAAAUAUCAAACAUUGUUAUGCAAGAAAUUAUUAAUUACAAAAUGAAGAUUUAUACCAUUGUGGUUUAAGCUGUACUGAACUAAAUCUGUGGAAUGCAUUGUGAACUGUAAAAGCAAAGUAUCAAUAAAGCUUAUAGACUUAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-721.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -766.01
Frequency: 0.0000
Diversity: 624.10
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........((((((..(((......)))....))))))(((((((...))).........(((((((...((((....(((((..(((..(((.....)))..)))..))))).(((((((((((..((((((....(((((((((((((.((....)))))(((((......)))))(((((((((((...(((......))).((..((((((..(........)..)))).))..))))))))))))).(((((((...((((((((..((((.((.(((((.((..(.(((.(.(((((((((((.((..(((((((((((((....)))))).)))((((((.(((...((.(((....(((((.(((((((...((((......)))).........))))))).)))))...)))))....)))..)))))).....(((......))).((((((((.(.(..((((.(((.((.((((.......)))).)).)).)...))))....).).))))))))..))))))))))).)))))).).))).)..))..))).))..))..))))..))))))))..((.....)).(((((((..(((.(((((.(..(((......)))..)..)))))..)))..(((............))).((((....)))).)))))))...(((((((.....)))).))).......)))))))((((((...((((.........))))...))))))((((...((((......)))).)))).........)))))).))))..)))))))))).......)))))))......((.((((.((((((.((((.((......)).)))).)))..)))...)))).)).(((((((..(((....((((((((....)))).))))........((((..(((((((...(((..........))).)))))))..)))).(((((((((.((((((.......)))))).))..)))))))..)))..)))))))(((.....)))..((((((((((((((((((.((((..(((((((......)))))))....))))...........(((((((((....))))))))))))))))((((.........))))(((((((((((((......(((((...((((((((((.((.....)).))))(((((((((..((((((......))))).)..)))(((........)))....)))))).(((((..((((((.(........).))))))..))).))..)))))))))))....))))...)))))))))))))))..)))))..))))(((.((....)).)))...)))))))(((((((.........)))))))(((((((((((.((((((((((......((((((((((((((((((((((.....((((((.((((...........((((((((......((((((((((.............(((((((((((((.......)))))..))))............(((((((.((((..(((((((((...........))))))))).)))).))))))).(((((((.....)))))))..))))))))))))))(((.................))).....((((((((((((((((((.((((.(((((.((.....((((((((((((....(((((((((.(((.....(((.((((((((.((((((((..(....)..)))))))).)))))))).))).(((.((.((((((.......)))))).))...)))................((((((((((((((((((...)))...(((.((........))...))).......(((((.(((((........))))).)))))..)))))))))))))))....(((......)))....))).))))))))))))))).......))))))..)).)))))....))))...))))))....................))))))))))))..)))))))))))).))))))....))))).)))).(((..(((.......(((((((((((....))))))....))))).....))))))..............)))))))))))))........(((((((........))))))).)))))))))))))))))).))).....((((..............))))...)))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,,..,,,,((((((..(((......)))....)))))),{||||{.,,}}}......,,,(((((((...{(((....(((((.(,((({,,,...,},)))},,))))).{({((((({{((((..((((((....(((((((((({({.((,.,,}}}}|(((((......)))))(((((((((((...(((......))).((..((((((..(........)..)))).))..)))))))))))))|((({{{{.{.((((((((..((((.((.(((((.((..(.(((.(.(((((((((((.((..(((((((((((((....)))))).)))((((((.,,(.({.....,((((.(.(((((((({((.,(,{{.,,...}|||....,..,,}))))))))))))....))))....,,)},)))))).....(((......))).((((((((.(.(..((((.{((.((.((((.......)))).)).)).)...))))....).).))))))))..))))))))))),,))))).).))).)..))..)))},).,))..))))..))))))))...(({{.({(.(((((,,..(((.(,({(.{.,{{{.....})}.,,...))))).,))}}.|||..,},,,.{,{,}|},(({{....)))).))))}})},}(((((((.....)))).))).......))))))}((((((...((((..,....,.))))...)))))){(((...((((......)))).)))}.......,.)))))).))))..))))))))))......}))))))}.,,..,{{.,{,..{{{(((.((((.((......)).)))).))}..,||,{{||||,{{,(((((((..((({,..((((((((....})))}}))),}}}}...((((..(((((((..,(((.........|)}}.}}))))}..}))}.{((((((,(,((((((.......)))))).}},.})}}}},.,)}}..))))))){{|,...,)),,.,.,}}||{{,||||{|||,{.{(,.{{.,||,||{{{{|,,,,,...}}}}}},,,}}}},,,,|{{((((((....))))))))}})))||},|{{{,.,|||,,|||,((((((({{{((({....,{{{{{...{|{|||{{{{.{{.....}}.))))|{{{{{|{{{,|{{{((|,,..,))))),},.|}}||...,.....}}},...}}}|||.{((((..((((((.{........}.))))))..))).)).,)))))))))},..}})}}},,.,}}))))))||)}}},}},},,..)))){{{.{(....)).)))...)))))))(((((((.........))))))),((((((((((.((((((((((.,.,{,((((((((((((((((((((((.....((((((.((((...........{(((((({...|,.(((((((((((..,,...,,,...||,{((((((((.......)))))..))))............(((((((.{(((..(((((((((...........))))))))).)))}.))))))).(((((({.....})))))).,}},)))))))))))|||.........................((((((((((((.(((((.((((.(((((,({,,{{.((((({,{(({{....{|||{{{{{.|||,.}}.(((.((((((((.{(((((((..(....}..)))))))}.)))))))).))){(((,{,,(((((,...{(({||{(({{{|,,,,,..,|||,.,,,.,,,,.|||||{|||||{||||||..,)))},.{{{,|{},,,....,|,,.|||.......{{{((,{((({........))))).))))),.}}}})}}||||}}}}....{||,,,...))),||||,|.}},},)))))}}|}},,,,,..}}}})},,}},}}})),...)))).))))},,|,...............,,..))))))))))))..))))))}})))).))))))....))))).)))).,,{..{{(...,,..{{(({(({(((,,..|}}}}}...})))}),,,.,)))))}..............})))))))))))).},,,...(((((((........))))))).))))))))))))))))))})}}||{..,{{{...,,.........)))).,,)))}.....
Back