Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_212492.4
Sequence Length
2336 nt
GC Content
0.6430
AGUGGACGGCACGCCGCGGCGGGGUGGGUGCAAGAUGCCGCUGCCGGUUCAGGUGUUUAACUUGCAGGUAACGAGCCGAGGCCGCCCCGGGCCUCCGCGCCCCCGCGCCCCCCGCCACUGGGGCCGGGCUGAGGUCGAGCAGGGGCGCGGGGCCUGCGCCAGGAGUCGGUCGGGCACGCUCCGUGCCGGGCCUCCGCGGGCAGCGCGCGUCGGGGGCUGCAGGGCCGAGGGCGCGUCUCCGCCGUGGCUGCGCGCUGCGAUCGGGGGCCGCCGGGCCGCGCCCGCCCCGCCUCCCCUCCCAGCAGCUCACGGGAGAGGUUCCCGGCCGCCCCGACGCUAACGCUCUUUCUCCCUUCAGCAGCCAGCCAGCUCUGUGUCAGGGUCGGGGGGUGCAGAAAGUCAGGACAGAAUGAGGGAUAGCUCGGCCCCCAGCUCGGCCUCCUCGUCAGUGACAGAUCUGUACUGCACCCCUCACAGCAGUAGGUCAGACCUCGUCCUGCCCGGCACGGCCGGGGACUUCAGCCUGAGCGCCAGCCUGUCGGCCUGUACGCUGCUCUACGAGGGGGCCGUGGAGCCCAUGCAGAUCGACGUGGACCCCCAGGAAGACCCGCAGAAUGCACCUGACGUCAACUACGUGGUGGAGAACCCCAGCCUGGAUCUGGAACAGUACGCGGCCAGCUACAGCGGCCUGAUGCGCAUCGAACGGCUGCAGUUCAUUGCUGAUCACUGCCCCACGCUGCGGGUGGAGGCCCUGAAGAUGGCCCUCUCCUUCGUGCAGAGAACCUUUAACGUGGACAUGUACGAGGAGAUCCACCGCAAGCUCUCAGAGGCCACCAGGGAGCUGCAGAACGCACCCGACGCCAUCCCUGAGAGCGGCGUGGAGCCCCCAGCCCUGGACACGGCCUGGGUGGAGGCCACGCGGAAGAAGGCGCUGCUGAAGCUGGAGAAGCUGGACACAGACCUGAAGAACUACAAGGGCAACUCCAUCAAAGAGAGCAUCCGGCGCGGCCACGACGACCUGGGCGACCACUACCUGGACUGUGGGGACCUCAGCAACGCCCUCAAGUGCUAUUCCCGGGCCCGGGACUACUGCACCAGCGCCAAACACGUCAUCAACAUGUGCCUCAAUGUCAUCAAGGUCAGCGUCUACUUGCAGAAUUGGUCUCAUGUGCUCAGCUACGUCAGCAAGGCUGAGUCCACCCCAGAGAUUGCCGAGCAGCGAGGAGAGCGUGACAGCCAGACCCAGGCCAUCCUCACCAAGCUCAAGUGUGCCGCAGGCUUGGCAGAGCUGGCCGCCAGGAAGUACAAGCAGGCUGCCAAGUGCCUCCUGCUGGCUUCCUUUGAUCACUGUGACUUCCCUGAGCUGCUGUCCCCCAGCAACGUGGCCAUCUACGGUGGCCUGUGCGCCUUGGCUACCUUUGACCGGCAGGAGCUGCAGCGCAAUGUCAUCUCCAGCAGCUCCUUCAAGUUGUUCUUGGAGCUGGAGCCACAGGUCCGAGACAUCAUCUUCAAAUUCUACGAGUCCAAGUACGCCUCAUGUCUCAAGAUGCUGGACGAGAUGAAGGACAACCUGCUCCUGGACAUGUAUCUGGCCCCCCAUGUCAGGACCCUGUACACCCAGAUUCGCAACCGUGCCCUCAUCCAGUAUUUCAGCCCCUACGUGUCAGCCGACAUGCAUAGGAUGGCGGCAGCCUUCAAUACCACGGUGGCCGCCCUGGAGGACGAGCUGACGCAGCUAAUCCUGGAGGGGCUGAUCAGUGCCCGUGUGGACUCACACAGCAAGAUCCUAUACGCCCGGGACGUGGAUCAGCGCAGCACCACCUUUGAGAAGUCUCUGUUGAUGGGCAAGGAGUUCCAGCGCCGCGCCAAGGCCAUGAUGCUGCGGGCAGCUGUGCUCCGCAACCAGAUCCAUGUCAAGUCCCCGCCCAGAGAAGGGAGCCAGGGGGAGCUGACUCCAGCCAACAGCCAGUCCCGGAUGAGCACCAACAUGUGAGGGGUGAACCUUGGCCUCCAGGACAUCUGCACCCCCUCCCCACCUCCACGGACCUCGGACCUCCAGGCGGCUCAGUGCUGCCUGCGGCCCAGCUAAGGGGCCUGGCCACUGGGUGCCACCCAGCCUGUGUGCCCUCCCUGGGGCUGAGGAGGCAGGCGGCUGCUAGUUGUGGCCCUUCCUGGAAGGAGAGGCCUGCAGGGCUCGACCCUGUGGGUUUCUGUCCCCAGGGAGCAGACUGUGCGGCACCCAGGCCCAGUGGCACCAUUUCCCAGACCCCUCCUGUUCCCGCCUCAGUCAGGUGCAGACAAGUGGGCGGUGUCCAUUAAAGAGCAGACUCAGCGUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1030.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1067.66
Frequency: 0.0000
Diversity: 417.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((..((..(.((.((((.(((((((.((((((...((((((((((((.....))))).((((....(((((((((.((..((((((.(((((((((.((((((((.(((.....))).)))....)))...)).))))))))))))))).))..((((.(((.(((((.((.((((.((..((((((((...((((((((((((((.((..((.(.(((...))).)))..)).)))..)).)))))))))...)))))))))))))).)).)))))..))).)))).....((((((((((.(((((((((((((((((((((.((.(((....((((((((((((((((((((..(((..((((((((((((((.(((((((((......(((((.(((..((.(((....((((((..(((...(((((((((((((((.(((((.((((((((((..........))))))...)))).)).))))))((((((...))))))...........(((((((((((....)).)))...)).)))).))))))))))))))).)))..(((.(.((..(.(((....))).)..)).).))).....((((..((((.....)))))))))))..)))))..)))..)))))....))))..(((((.((.(((.(((((.((.((((.((...((..((((((((....)))..))))).)).)).)))).))..)))))))).)).))))).((((((.((((((.....((........))...))))))))))))(((((.((..((((((((.(((.....(((.((........)).)))...)))....)))))))).))))))).))))).)))))).....(((((......))))))))))).))..)))))))))))))..)))))...((((......(((...........))).....))))...)))))))).)).)).))))))...(((..(((((.........)))))..))))))))))))......((.((...((((...(((((....))))).....)))).)).))....(((((.......)))))..(((..((.(((((.((((((.(((.(((((....((((((((.((.((((((((..........)))))))).)).....)))...)))))...))))).))))).))))...........(((((..(((.(((((((...(((...))).)))))))..))).)))))...(((((((...((((((..((.....))..)))))).)))))))))))).))..)))..)))))))))))))).......(((.((.(((((((...)))))))))))))))))))))))))..)))))))(((((((((..................)))))))))..(((.((.(((((((.(((......))).)))))))...)).)))..........(((.((((((((.((((((((((((.(((((((((.(((....(((....)))..(((((.(((((............))))))))))..(((......)))....(((....))).))).)))))))))(((((((((.((((((....))))))........((((((.(((...........))).))))))....((((..(((((...)))))..))))..)))))))))....(((..(((((....))))).))).............((((((((((((((....(((((........(((....)))))))).(((....(((((..(((((((.(((...(((......))))))))).)))).)))))....))))))))))((((..(((((((((.......)).))...)))))..))))....((.....))..))))))).)))).......)))))))).)))...))))).)))..)).)))))))))))...)))).)).)..))..))..((.((..((((((((.....)))))))).))))(((...(((((.((((......((((((((...(((((.(((((.(((((((((((.((((((..(((.((........)).))))))))).)....((((((((((((((.....))))))))))))))).)))))))))(((.....)))))))).)))))...)))))))).....)))).))))).)))...((((((..(((.......)))....)))))).)))))))...(((....)))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((((({,{.((((({((.((((.((((((,,((((((..{((((((((((((.....))))).((((,...{((((((((.((..((((((.(((((((((.((((((((,(((.....))),)))....)))...)).))))))))))))))).)}..((((.(((.(((((.((.((((.((..((((((((...((((((((((((((,((..({.(.(((...))).)}}..)).)),,})).)))))))))...)))))))))))))).)).)))))..))).)))).....((((((((((.((((((((((((((((((({(,((.(((....((((((((((((((((((((..(((..((((((((((((((.(((((((((.,....(((((.(((..((.(((....((((((,.({{...((((((((((((((({(((((.{(({{(((((..........))))))|..}}|}.,,.}}}}}}{(((((,.,||}||}|.|,..,,...||||{||,|||,,,,))})))}.))))).,..))))))))))))})).))},.(((.(.((..(.(((....))).)..)).).)))....,{{{{..((((.....)))))))})))..)))))..)))..)))))....)))),.(((((.((.(((.(((((.((.((((.((...((..((((({{,..,,}))..}}}))}}}.)).)))).)).,)))))))).)).))))),((((({{((((((.....((........))...))))))))))))(((({{((..((((((((.(((.....(((.((........)).)))...)))..,.)))))))).))))))).))))).)))))),,,,,||{((,..,,,}}}))))}))).,)..)))))))))))))..)))))},,(({{..,,}.(((...........))).....}}},....})))))).)),)).))))))...{{{.,({(({.........))}))..})}))))))))).,,..,{{.,{...((((|..(((((....))))).....)))).}),)}....(((((.......}))))..{((..((.((({{{((((((.(({.(((((.,..((((((((.,({((((((((..........)))))))}.))}....)))}..})))).|.))))).|)}|},||}}.,,,.,...,,(((({.,{|{.(((((({...{{{...})).)))))))..))),)))))...(((((((.{.{(((((..((.....))..))))))})))))))})))).))..)))..)))))))))))))).......(({,((.(((((((...)))))))))))))))))))))))))..)))))))|((((((((..................)))))))),..,,(.((.(((((((.(((......))).)))))))}}.),.,,,..........(((.((((((((.((((((((((({,(((((((((.(((....(((....))),,{((({({((((.....{{...,.)))))))))}..(((......)))....(({....))).))).)))))))))|((((((((.((((((....))))))...,,...((((((.(((...........))).))))))}}..((((..(((((...)))))..))))..))))))))|,,..(((..(((((....))))).))}.},,.........((((((((((((((.{.{(,((.{{{.,...(((....}))||,,}.}}}))..(((((..(((((((.(((...(((......))))))))).)))).))))),,...,.)))))))((((..(((((((((......,)).))...)))))..))))....{{.....}}..))))))).}))).,,....}})))))).)))...))))).)))..)).)))))))))))...)))).)).{,.,,,..{,.((.((..((((((((.....)))))))).))})|||...(((((.((((......((((((((...(((((.(((((,((((((((({(.((((((..(((.((........)).))))))))).}..,.((((((((((((((.....)))))))))))))).,)))))))))|{{.....}}}))))).)))))...)))))))).....)))).))))).,((((..(((((.....)))))..)))}.))))))))))))))))...(((....)))......
Back