Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_213636.3
Sequence Length
1008 nt
GC Content
0.6597
GUCAGAACACUGGCGGCCGAUCCCAACGAGGCUCCCUGGAGCCCGACGCAGAGCAGCGCCCUGGCCGGGCCAAGCAGGAGCCGGCAUCAUGGAUUCCUUCAAAGUAGUGCUGGAGGGGCCAGCACCUUGGGGCUUCCGGCUGCAAGGGGGCAAGGACUUCAAUGUGCCCCUCUCCAUUUCCCGGCUCACUCCUGGGGGCAAAGCGGCGCAGGCCGGAGUGGCCGUGGGUGACUGGGUGCUGAGCAUCGAUGGCGAGAAUGCGGGUAGCCUCACACACAUCGAAGCUCAGAACAAGAUCCGGGCCUGCGGGGAGCGCCUCAGCCUGGGCCUCAGCAGGGCCCAGCCGGUUCAGAGCAAACCGCAGAAGGCCUCCGCCCCCGCCGCGGACCCUCCGCGGUACACCUUUGCACCCAGCGUCUCCCUCAACAAGACGGCCCGGCCCUUUGGGGCGCCCCCGCCCGCUGACAGCGCCCCGCAGCAGAAUGGACAGCCGCUCCGACCGCUGGUCCCAGAUGCCAGCAAGCAGCGGCUGAUGGAGAACACAGAGGACUGGCGGCCGCGGCCGGGGACAGGCCAGUCGCGUUCCUUCCGCAUCCUUGCCCACCUCACAGGCACCGAGUUCAUGCAAGACCCGGAUGAGGAGCACCUGAAGAAAUCAAGGGAAAAGUAUGUCCUGGAGCUGCAGAGCCCACGCUACACCCGCCUCCGGGACUGGCACCACCAGCGCUCUGCCCACGUGCUCAACGUGCAGUCGUAGCCCGGCCCUCUCCAGCCGGCUGCCCUCUCUGCCUCCCUCUUUCUGUUCCUCCUGCCCAGGGCACCCCCUUAGUGCCUCCAGCUUCUGCCUACCUCACCCCCCCUUUCGUGCCCCUGGCCUGAGCCUCCUGCUGGCCUGGCCCUGGCCGCCCACCUGGGUUCAUCUGACACUGCCUUCCCUCUUUGCCCUGUGGUACUGCUGUCUGCCAGGUCUGUGCUGCCUUGGGCAUGGAAUAAACAUUCUCAGCCCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-429.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -448.01
Frequency: 0.0000
Diversity: 303.07
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((....)))))(((.(.......((.(((((....))))))).((((((.(.((((((((((((((((.((.(((((((((....(((((.............(((((((.....)))))))((((.((((...)))).))))((((((............))))))..)))))...))))))).)).))((((((.......(((((((((((((.(((...))).)))..((.((((((.(((((((.(((...((.....)))))...).)))))).)))))).)).....)).)))))))).((((.(((((.((((((((((.....))))))))..((((.......)))))).).))))))))))))))((((((((...))))))))........((.....))((((.........)))))))))))))....)))))))........((.(((((((..((((((((((..((.((((((((.(....((((((.......))))))..).))))))))..((......(((((((((((.((..((((((((((.(((((((((.(.((((..((((....(((((....(((.........))).....)))))...)))).((((((((...(((((......((((..(((((((...((....(((((((..........((((....)))).((((.....)))).))))))))))))))))....(.((((..((((((.(((........))))))))).....)))))))))))))).))))))))..(((..((((((.......(((......((....))......)))..........))))))..)))..))))...).))))))))).)))))))))))).))..))))).))))......))...))..)))))..)))))...))))))).))..).))))))).)))..((((..(((((....)))))..))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,,,,....,,|||(((,{,,{....((.(((((....)))))))..(((({,(((((((,,(((((((((.,({(((((((((....(((((.............(((((((.....)))))))((((.((((...)))).))))((((((............))))))..)))))...))))))}.||,|,{{||((,..|,(((,((((((((.(.(((({.(((|{,,,(((({((((((.(((((({.(,(...((.....))))).,.,.)))))).))))))...,,{..|{((({{|{|(((((((((,,,.(,((((((((.....)))))))),,(((,{{{{{...||||{.{{,||,,|||{|....,,,|||||.},)),)))))....))))),))),,)}|,||}}}}......},,)))))))},},,.|||||||...||,..,,.|,,,|||}}|||{{(((((,,((.((((((((.(....((((((.......))))))..).))))))))..(((({{{{{(((((,,,(({((..(((((((((({,(((((,{,.{,((((({((((..,.{((((....(((.........))).....)))))}..)))}.,||||||.{{{{{,,,..,,.|||{,.......((((((((({.(..,(((....))).,..,.),})))))))){((,....}}}{{{..{{{{..((((.....))))))}}.,||{|||,|||,.,.,,,.})))))))).....))))},}))))),,.))))}}))}.,,,..((((((.......)))))},,,{{}}}}))......)))}}.,,,...,),))))}})))}}),))}.,)})))))))))})),,))),}}||,|,.{|||,,.,,,|......,,.,,,,..,,,))}},))))....))))))}))..))}},),))))))..((((.,(((((....))))},,))))..
Back