Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_213657.3
Sequence Length
1446 nt
GC Content
0.3928
GUCUACAUUGAGACUACAGUUGAUAUGCCUACCUCCUGAGACACUAGUGUGUGAGUCUCCUCCUGGGCCCCUGGGCAAAUGGUUUUGGCAGCAUGACCAAGGCCUAAAUGGGGCUGAAGGCAAGCACAGGAGGAUGGGUCCCUUUUCAGGUCUGGAGAUGGAAUCACUGUUGCUAUAGCAGGCCUUUUUAUGAGACUAACCUGGCCUCUCCACUAAAGGAUGUGUGACUUUCUGGGGACAGAAGAGUACAGUCCCUGACAUCACACACUGCAGAGAUGGAUAACCAAGGAGUAAUCUACUCAGACCUGAAUCUGCCCCCAAACCCAAAGAGGCAGCAACGAAAACCUAAAGGCAAUAAAAACUCCAUUUUAGCAACUGAACAGGAAAUAACCUAUGCGGAAUUAAACCUUCAAAAAGCUUCUCAGGAUUUUCAAGGGAAUGACAAAACCUAUCACUGCAAAGAUUUACCAUCAGCUCCAGAGAAGCUCAUUGUUGGGAUCCUGGGAAUUAUCUGUCUUAUCUUAAUGGCCUCUGUGGUAACGAUAGUUGUUAUUCCCUCACGUCAUUGUGGCCAUUGUCCUGAGGAGUGGAUUACAUAUUCCAACAGUUGUUACUACAUUGGUAAGGAAAGAAGAACUUGGGAAGAGAGUUUGCUGGCCUGUACUUCGAAGAACUCCAGUCUGCUUUCUAUAGAUAAUGAAGAAGAAAUGAAAUUUCUGUCCAUCAUUUCACCAUCCUCAUGGAUUGGUGUGUUUCGUAACAGCAGUCAUCAUCCAUGGGUGACAAUGAAUGGUUUGGCUUUCAAACAUGAGAUAAAAGACUCAGAUAAUGCUGAACUUAACUGUGCAGUGCUACAAGUAAAUCGACUUAAAUCAGCCCAGUGUGGAUCUUCAAUAAUAUAUCAUUGUAAGCAUAAGCUUUAGAGGUAAAGCGUUUGCAUUUGCAGUGCAUCAGAUAAAUUGUAUAUUUCUUAAAAUAGAAAUAUAUUAUGAUUGCAUAAAUCUUAAAAUGAAUUAUGUUAUUUGCUCUAAUAAGAAAAUUCUAAAUCAAUUAUUGAAACAGGAUACACACAAUUACUAAAGUACAGACAUCCUAGCAUUUGUGUCGGGCUCAUUUUGCUCAACAUGGUAUUUGUGGUUUUCAGCCUUUCUAAAAGUUGCAUGUUAUGUGAGUCAGCUUAUAGGAAGUACCAAGAACAGUCAAACCCAUGGAGACAGAAAGUAGAAUAGUGGUUGCCAAUGUCUGAGGGAGGUUGAAAUAGGAGAUGACCUCUAACUGAUAGAACGUUACUUUGUGUCGUGAUGAAAACUUUCUAAAUUUCAGUAGUGGUGAUGGUUGUAACUCUGCGAAUAUACUAAACAUCAUUGAUUUUUAAUCAUUUUAAGUGCAUGAAAUGUAUGCUUUGUACACGACACUUCAAUAAAGCUAUCCAGAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-380.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -411.12
Frequency: 0.0000
Diversity: 331.74
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((......))))....(((((...((((((((((((..((((....)))).........(((.(((((((((((...(((((.((....)).)))))..)))))...))))))..)))......))))))).))))).....((((((((((.((.((((...(((.((((....))(((((..................))))).((((((...((.(((((((...((.((((((...........))))))))..)))))))))....)).))))......)).)))..)))))))))))))))).(((((.(..........).))))).........((....)).........((((((((((((..(((...(((......)))...))).......((((((....((((((((((((.....((((((((((((...(((((...((...(((.....))).)).(((.(((.((.(((((.((((((....(((....)))))))))...))))))).))).)))....)))))))))))))))))((((....))))......))))))))))))(((........)))...(((....)))((((((((((((..((..((((((.......)))))).))..)))............(((....((((((((((......(((((.((((((((...)))))).))..))))).((((((((....))).)))))((((....))))...(((....((((((((((((......((((...((((((....(((((......((((((.(((((((((.((......)).))))((((((((((....((...((((.(((((.(((((..(((((((((((....(((((((((((...((((((....))))))...)))..)))))))).............((((((((((......))))))))))...((((.....)))).......(((((.(.(((((......))))).).))))).......))))))))....)))..)))))...............(((((..........)))))))))).))))...)).......))))))))))...((((..........))))...))))).))))))..))))).))))))))))......)))..))))))))))))))))))))))..)))...))))))))).))))))..)))))))).))))((.(((.(((.(((((((((((((((........))))))......)))))....))))))).))).)).(((((.....(((((((((((....(((((((((((...)))))......))).)))....))))).)))))).)))))...))))).........................
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((......}))}..,.{{{,.,,{{{(,(((((((,{{((((....}}|},,{{{{,{{{{(,(((((((((((...(((((.((....)).)))))..)))))...)))))).,,}},...},))))))).{||{}.....(((((((((((((,({{{.{,,(({((({..,.)}|((((...,,,......},,...))))}.((({{{...{{.(((((((...((.((((((...........))))))))..)))))))})....)).)))}...},.,}})}}.,)))})))))))))))).{{{{{}|,.........,.))}}|,..,.....,,...,|||......,,{{{,.,,,(((((((((...(((......)))....{(,......|||,|.....((((((((((((.....((((((((((((...(((((.,,,,..,|,,...,,|,}.},.{((,(({.((,(({{(.((((((...{(({....,}}}))}}),},))))))),))),))),,..)))))))))))))))))((((....})))......))))))))))))(((........)))..))))))))},,{,,,|||{{{{{..{{..{{{{||.,,....)))))).)).,))).,.,|.....,.,|,,,..((((((((((......{((((.{,((((((...)))))).,,..))))).((((((((....)))}}))))((((....})))...(((....((((((((((((......((((...((((((....(((((......((((((.(((((({{({(({,....|,,|}|,((((((((((.,,.((...((((.(((((.(((((.,(((((((((((....(((((((((((...((((((....))))))...)))..)))))))).,,..........((((((((((......)))))))))).,}{|{{,|||,|,||.......(((({.{.(((((......))))).).})))).......))))))))....))),.)))))...,,,....}},..(((((..........)))))))))).))))...))....,..))))))))))...,,||,,,.....)))))}},,))))).))))))..))))).))))))))))......))),.})))))))))))))))))))))...)))))))))}})))}}.}}}|||||,,..,,.{{{{..,,}))))..{{(((((....,,.....(((((((({{(((.......{{{(..((({{,{(({{({((,(((((....}}}}}.,,}}},,..)))})))))..}}}),,|,,,.,,,.,{{{||,,,,.}))}}}))}}.)))))))).....,....))))},)).............
Back