Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_213674.1
Sequence Length
1182 nt
GC Content
0.6117
GCGGCCGCACCCCCCGGCCGGGCCGUGCUUCUGCCCCUACAAGGUUUGGGCCGAGGUGGGGGAGGGUCCUGGUUGCCGGCCCCGCCCGGUCCCUCCCCGCCUUUUAGGCGCCCGCGUGGCCGGGACGUCCCAGUCCCGCUCCGUCCUCCUCGCCUGCCACCGGUGCACCCAGUCCGCUCACCCAGCCCAGUCCGUCCGGUCCUCACCGCCUGCCGGCCGGCCCACCCCCCACCGCAGCCAUGGACGCCAUCAAGAAGAAGAUGCAGAUGCUGAAGCUGGACAAGGAGAACGCCAUCGACCGCGCCGAGCAGGCCGAAGCCGACAAGAAGCAAGCUGAGGACCGCUGCAAGCAGCUGGAGGAGGAGCAGCAGGCCCUCCAGAAGAAGCUGAAGGGGACAGAGGAUGAGGUGGAAAAGUAUUCUGAAUCCGUGAAGGAGGCCCAGGAGAAACUGGAGCAGGCCGAGAAGAAGGCCACUGAUGCUGAGGCAGAUGUGGCCUCCCUGAACCGCCGCAUUCAGCUGGUUGAGGAGGAGCUGGACCGGGCCCAGGAGCGCCUGGCUACAGCCCUGCAGAAGCUGGAGGAGGCCGAGAAGGCGGCUGAUGAGAGCGAGAGAGGAAUGAAGGUCAUCGAAAACCGGGCCAUGAAGGAUGAGGAGAAGAUGGAACUGCAGGAGAUGCAGCUGAAGGAGGCCAAGCACAUCGCUGAGGAUUCAGACCGCAAAUAUGAAGAGGUGGCCAGGAAGCUGGUGAUCCUGGAAGGAGAGCUGGAGCGCUCGGAGGAGAGGGCUGAGGUGGCCGAGAGCCGAGCCAGACAGCUGGAGGAGGAACUUCGAACCAUGGACCAGGCCCUCAAGUCCCUGAUGGCCUCAGAGGAGGAGUAUUCCACCAAAGAAGAUAAAUAUGAAGAGGAGAUCAAACUGUUGGAGGAGAAGCUGAAGGAGGCUGAGACCCGAGCAGAGUUUGCCGAGAGGUCUGUGGCAAAGUUGGAGAAAACCAUCGAUGACCUAGAAGAGACCUUGGCCAGUGCCAAGGAGGAGAACGUCGAGAUUCACCAGACCUUGGACCAGACCCUGCUGGAACUCAACAACCUGUGAGGGCCAGCCCCACCCCCAGCCAGGCUAUGGUUGCCACCCCAACCCAAUAAAACUGAUGUUACUAGCCUCUCAAGGCCCUUUAAUCCUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-450.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -472.36
Frequency: 0.0000
Diversity: 342.81
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((.......)))))(((((((((((..((((((.((.((...((((((.(((((((..((..........))..)))))))))))))...)).((((...))))(((.....)))((((((......)))))).((((((((((((((((....(((((....((..(((((((...(((((..(.((.(((((.((((.(((((((((((((.((((.....(((((.((.((.((..(.((.((..........(((((..(((..((((.............((..(((.((((.....)).)).))).))............))))..)).)..)))))(((..((...(((((.((.....)))))))...))..))))).)))..))..)).)).)))))...(((.(((((..(((.....)))....)))))...))))).)).)))))......(((((((...(((....)))...))))))).(((.((((((........)).)))).)))(((.((((..((((((........))))))...)))))))))))..)).))..))))))).)).))))))))....))))).))..)).((((...)))).....))))).......))).)))))))..)))))).(((((.....))))).)).))).))).))))))....((((....)))).............((.(((.(((((....))))).))))).....(((((((((((((.((((...(..(((.((.((((((....(((((((((.....(((((.((.((....((........))...((((((((..(((((((.....)))).)))..(((.((((.((((((..(((...............)))...)).)))).))))..)))..(((..(.((((..((.(((((.(((((....(((((((((((......(((......)))((((((.(((........(((((((....))))))))))....))))))...))).))))))))....))))).)))))))..)))).)..))).))))))))....)).)).)))))..)))).))))))))))).)).)))..)....)))))))).)))).)))))..)))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((.......)))))(((((((((((..((((((.{,.{{...(((((({((((((({((((.((.(({.{,,....},))),)).))))))))||||}...})}|||}|{,,{{|{((({(...,..)))))}|(((((((((((((((({{,.(((((.,.,((.,((({(((.,{(((((,.((({,({((((((((,,{(((((((((((((,,......((({,.(((({,(,..,,{((((........))))}.,,}})))..|,})}....{{......}}.,,}.))).)))).)))))),|..{{,,.......,,..)})}}))}))||||}..,{||((...(((((.((.....))))))).......)))}..)))}.}},.}}|}|.)})}|.......,{||{..(((.....))).,{{(({......)))).)),}}}}}....,.{((((((...(((....)))...))))))),{{{.{((({|,,|...,.))})))),)))|||,||{|},|{|||{.,....,.)))))),..)}))|||,|||..})})},,).}|||}.,..))))))))....}}))}.)},,)),,{{{.,,}}}},....}}))),|,....))).))}))))..)))))}.(((((.....))))),}}.))).))).})))))....((((....)))).{{,,........,,.{||.{((((....))))).})))),,...(((((((((((((.((((...{..(((.((.((((((....(((((((((.,...(((((.((.((..,.,{......,{|....((((((((..{{(({{{.,,,,||}}.}))}}({{.{(((.((({,{..{{{.....,.........}))...}}.)))).)))}..})}..(((..(.((((..((.{((((.(((((,,..(((((((((({......(((......))}((((((.(((........(((((((....))))))))))....))))))...}))}}))))))),,..))))).)))))))..)))).)..))).)))))))).}..)).)).))))),.)))).))))))))))).)).)))..}....)))))))).))))}}))))..)))))..........
Back